Protein–RNA interactions for Protein: Q9H158

PCDHAC1, Protocadherin alpha-C1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHAC1Q9H158 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHAC1Q9H158 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHAC1Q9H158 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHAC1Q9H158 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHAC1Q9H158 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHAC1Q9H158 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHAC1Q9H158 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHAC1Q9H158 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHAC1Q9H158 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHAC1Q9H158 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHAC1Q9H158 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHAC1Q9H158 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHAC1Q9H158 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHAC1Q9H158 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHAC1Q9H158 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHAC1Q9H158 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHAC1Q9H158 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHAC1Q9H158 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHAC1Q9H158 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHAC1Q9H158 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHAC1Q9H158 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHAC1Q9H158 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDHAC1Q9H158 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHAC1Q9H158 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHAC1Q9H158 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDHAC1Q9H158 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDHAC1Q9H158 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PCDHAC1Q9H158 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHAC1Q9H158 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHAC1Q9H158 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDHAC1Q9H158 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDHAC1Q9H158 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDHAC1Q9H158 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDHAC1Q9H158 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDHAC1Q9H158 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDHAC1Q9H158 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDHAC1Q9H158 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDHAC1Q9H158 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDHAC1Q9H158 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHAC1Q9H158 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHAC1Q9H158 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDHAC1Q9H158 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHAC1Q9H158 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHAC1Q9H158 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHAC1Q9H158 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHAC1Q9H158 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHAC1Q9H158 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHAC1Q9H158 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHAC1Q9H158 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHAC1Q9H158 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHAC1Q9H158 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHAC1Q9H158 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHAC1Q9H158 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDHAC1Q9H158 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHAC1Q9H158 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHAC1Q9H158 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHAC1Q9H158 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHAC1Q9H158 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHAC1Q9H158 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHAC1Q9H158 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHAC1Q9H158 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHAC1Q9H158 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHAC1Q9H158 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHAC1Q9H158 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHAC1Q9H158 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHAC1Q9H158 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCDHAC1Q9H158 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHAC1Q9H158 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHAC1Q9H158 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHAC1Q9H158 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHAC1Q9H158 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHAC1Q9H158 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHAC1Q9H158 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHAC1Q9H158 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHAC1Q9H158 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHAC1Q9H158 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHAC1Q9H158 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHAC1Q9H158 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHAC1Q9H158 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHAC1Q9H158 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHAC1Q9H158 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHAC1Q9H158 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHAC1Q9H158 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDHAC1Q9H158 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDHAC1Q9H158 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDHAC1Q9H158 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHAC1Q9H158 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHAC1Q9H158 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDHAC1Q9H158 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDHAC1Q9H158 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDHAC1Q9H158 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDHAC1Q9H158 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDHAC1Q9H158 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCDHAC1Q9H158 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PCDHAC1Q9H158 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCDHAC1Q9H158 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCDHAC1Q9H158 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHAC1Q9H158 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDHAC1Q9H158 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDHAC1Q9H158 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms