Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2J2Q9GZM3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2J2Q9GZM3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR2J2Q9GZM3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR2J2Q9GZM3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR2J2Q9GZM3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR2J2Q9GZM3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR2J2Q9GZM3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2J2Q9GZM3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2J2Q9GZM3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2J2Q9GZM3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR2J2Q9GZM3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
POLR2J2Q9GZM3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR2J2Q9GZM3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR2J2Q9GZM3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR2J2Q9GZM3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR2J2Q9GZM3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2J2Q9GZM3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2J2Q9GZM3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR2J2Q9GZM3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR2J2Q9GZM3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR2J2Q9GZM3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR2J2Q9GZM3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR2J2Q9GZM3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR2J2Q9GZM3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR2J2Q9GZM3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR2J2Q9GZM3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR2J2Q9GZM3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2J2Q9GZM3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2J2Q9GZM3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2J2Q9GZM3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2J2Q9GZM3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR2J2Q9GZM3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2J2Q9GZM3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2J2Q9GZM3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2J2Q9GZM3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR2J2Q9GZM3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR2J2Q9GZM3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2J2Q9GZM3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2J2Q9GZM3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2J2Q9GZM3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2J2Q9GZM3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2J2Q9GZM3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2J2Q9GZM3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2J2Q9GZM3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2J2Q9GZM3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2J2Q9GZM3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2J2Q9GZM3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2J2Q9GZM3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR2J2Q9GZM3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR2J2Q9GZM3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2J2Q9GZM3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2J2Q9GZM3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2J2Q9GZM3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR2J2Q9GZM3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR2J2Q9GZM3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR2J2Q9GZM3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2J2Q9GZM3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2J2Q9GZM3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2J2Q9GZM3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2J2Q9GZM3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2J2Q9GZM3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2J2Q9GZM3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2J2Q9GZM3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2J2Q9GZM3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2J2Q9GZM3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2J2Q9GZM3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2J2Q9GZM3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2J2Q9GZM3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2J2Q9GZM3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2J2Q9GZM3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2J2Q9GZM3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2J2Q9GZM3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2J2Q9GZM3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2J2Q9GZM3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2J2Q9GZM3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2J2Q9GZM3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLR2J2Q9GZM3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2J2Q9GZM3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR2J2Q9GZM3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2J2Q9GZM3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2J2Q9GZM3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2J2Q9GZM3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2J2Q9GZM3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2J2Q9GZM3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2J2Q9GZM3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2J2Q9GZM3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2J2Q9GZM3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2J2Q9GZM3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2J2Q9GZM3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2J2Q9GZM3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2J2Q9GZM3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2J2Q9GZM3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2J2Q9GZM3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
POLR2J2Q9GZM3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
POLR2J2Q9GZM3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2J2Q9GZM3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2J2Q9GZM3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms