Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ71

PITPNM3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM3Q9BZ71 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PITPNM3Q9BZ71 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PITPNM3Q9BZ71 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PITPNM3Q9BZ71 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PITPNM3Q9BZ71 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PITPNM3Q9BZ71 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PITPNM3Q9BZ71 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PITPNM3Q9BZ71 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PITPNM3Q9BZ71 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PITPNM3Q9BZ71 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PITPNM3Q9BZ71 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PITPNM3Q9BZ71 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PITPNM3Q9BZ71 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PITPNM3Q9BZ71 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PITPNM3Q9BZ71 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PITPNM3Q9BZ71 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PITPNM3Q9BZ71 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PITPNM3Q9BZ71 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PITPNM3Q9BZ71 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PITPNM3Q9BZ71 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PITPNM3Q9BZ71 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PITPNM3Q9BZ71 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PITPNM3Q9BZ71 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PITPNM3Q9BZ71 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PITPNM3Q9BZ71 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PITPNM3Q9BZ71 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PITPNM3Q9BZ71 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PITPNM3Q9BZ71 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PITPNM3Q9BZ71 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PITPNM3Q9BZ71 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PITPNM3Q9BZ71 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PITPNM3Q9BZ71 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PITPNM3Q9BZ71 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PITPNM3Q9BZ71 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PITPNM3Q9BZ71 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PITPNM3Q9BZ71 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PITPNM3Q9BZ71 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PITPNM3Q9BZ71 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PITPNM3Q9BZ71 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PITPNM3Q9BZ71 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PITPNM3Q9BZ71 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PITPNM3Q9BZ71 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PITPNM3Q9BZ71 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PITPNM3Q9BZ71 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PITPNM3Q9BZ71 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PITPNM3Q9BZ71 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PITPNM3Q9BZ71 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PITPNM3Q9BZ71 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PITPNM3Q9BZ71 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PITPNM3Q9BZ71 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PITPNM3Q9BZ71 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PITPNM3Q9BZ71 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PITPNM3Q9BZ71 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PITPNM3Q9BZ71 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PITPNM3Q9BZ71 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PITPNM3Q9BZ71 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PITPNM3Q9BZ71 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PITPNM3Q9BZ71 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PITPNM3Q9BZ71 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PITPNM3Q9BZ71 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PITPNM3Q9BZ71 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PITPNM3Q9BZ71 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PITPNM3Q9BZ71 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PITPNM3Q9BZ71 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PITPNM3Q9BZ71 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PITPNM3Q9BZ71 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PITPNM3Q9BZ71 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PITPNM3Q9BZ71 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PITPNM3Q9BZ71 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PITPNM3Q9BZ71 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PITPNM3Q9BZ71 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PITPNM3Q9BZ71 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PITPNM3Q9BZ71 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PITPNM3Q9BZ71 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PITPNM3Q9BZ71 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PITPNM3Q9BZ71 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PITPNM3Q9BZ71 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PITPNM3Q9BZ71 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PITPNM3Q9BZ71 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PITPNM3Q9BZ71 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PITPNM3Q9BZ71 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PITPNM3Q9BZ71 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PITPNM3Q9BZ71 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PITPNM3Q9BZ71 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PITPNM3Q9BZ71 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PITPNM3Q9BZ71 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PITPNM3Q9BZ71 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PITPNM3Q9BZ71 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PITPNM3Q9BZ71 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PITPNM3Q9BZ71 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PITPNM3Q9BZ71 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PITPNM3Q9BZ71 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PITPNM3Q9BZ71 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PITPNM3Q9BZ71 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PITPNM3Q9BZ71 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PITPNM3Q9BZ71 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PITPNM3Q9BZ71 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PITPNM3Q9BZ71 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PITPNM3Q9BZ71 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PITPNM3Q9BZ71 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms