Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD6

MRPL1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL1Q9BYD6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MRPL1Q9BYD6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MRPL1Q9BYD6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MRPL1Q9BYD6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MRPL1Q9BYD6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MRPL1Q9BYD6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MRPL1Q9BYD6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MRPL1Q9BYD6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MRPL1Q9BYD6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MRPL1Q9BYD6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MRPL1Q9BYD6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MRPL1Q9BYD6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MRPL1Q9BYD6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MRPL1Q9BYD6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MRPL1Q9BYD6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MRPL1Q9BYD6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MRPL1Q9BYD6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MRPL1Q9BYD6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MRPL1Q9BYD6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MRPL1Q9BYD6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MRPL1Q9BYD6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MRPL1Q9BYD6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
MRPL1Q9BYD6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MRPL1Q9BYD6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MRPL1Q9BYD6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MRPL1Q9BYD6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MRPL1Q9BYD6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MRPL1Q9BYD6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MRPL1Q9BYD6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MRPL1Q9BYD6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MRPL1Q9BYD6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MRPL1Q9BYD6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MRPL1Q9BYD6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MRPL1Q9BYD6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MRPL1Q9BYD6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MRPL1Q9BYD6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MRPL1Q9BYD6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MRPL1Q9BYD6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MRPL1Q9BYD6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MRPL1Q9BYD6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MRPL1Q9BYD6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MRPL1Q9BYD6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
MRPL1Q9BYD6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MRPL1Q9BYD6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MRPL1Q9BYD6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MRPL1Q9BYD6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
MRPL1Q9BYD6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MRPL1Q9BYD6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MRPL1Q9BYD6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
MRPL1Q9BYD6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MRPL1Q9BYD6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MRPL1Q9BYD6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MRPL1Q9BYD6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MRPL1Q9BYD6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MRPL1Q9BYD6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
MRPL1Q9BYD6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MRPL1Q9BYD6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MRPL1Q9BYD6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MRPL1Q9BYD6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MRPL1Q9BYD6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MRPL1Q9BYD6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MRPL1Q9BYD6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MRPL1Q9BYD6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MRPL1Q9BYD6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MRPL1Q9BYD6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MRPL1Q9BYD6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MRPL1Q9BYD6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MRPL1Q9BYD6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MRPL1Q9BYD6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MRPL1Q9BYD6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MRPL1Q9BYD6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MRPL1Q9BYD6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MRPL1Q9BYD6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MRPL1Q9BYD6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MRPL1Q9BYD6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MRPL1Q9BYD6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MRPL1Q9BYD6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MRPL1Q9BYD6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MRPL1Q9BYD6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MRPL1Q9BYD6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MRPL1Q9BYD6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MRPL1Q9BYD6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MRPL1Q9BYD6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MRPL1Q9BYD6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MRPL1Q9BYD6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRPL1Q9BYD6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRPL1Q9BYD6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MRPL1Q9BYD6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MRPL1Q9BYD6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MRPL1Q9BYD6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MRPL1Q9BYD6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MRPL1Q9BYD6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MRPL1Q9BYD6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRPL1Q9BYD6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MRPL1Q9BYD6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MRPL1Q9BYD6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MRPL1Q9BYD6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MRPL1Q9BYD6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MRPL1Q9BYD6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MRPL1Q9BYD6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms