Protein–RNA interactions for Protein: Q99961

SH3GL1, Endophilin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL1Q99961 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3GL1Q99961 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3GL1Q99961 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3GL1Q99961 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH3GL1Q99961 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SH3GL1Q99961 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SH3GL1Q99961 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SH3GL1Q99961 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SH3GL1Q99961 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SH3GL1Q99961 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH3GL1Q99961 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH3GL1Q99961 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SH3GL1Q99961 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SH3GL1Q99961 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH3GL1Q99961 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH3GL1Q99961 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH3GL1Q99961 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH3GL1Q99961 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH3GL1Q99961 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH3GL1Q99961 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH3GL1Q99961 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH3GL1Q99961 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SH3GL1Q99961 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SH3GL1Q99961 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SH3GL1Q99961 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SH3GL1Q99961 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SH3GL1Q99961 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SH3GL1Q99961 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SH3GL1Q99961 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SH3GL1Q99961 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SH3GL1Q99961 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SH3GL1Q99961 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH3GL1Q99961 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH3GL1Q99961 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH3GL1Q99961 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH3GL1Q99961 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SH3GL1Q99961 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SH3GL1Q99961 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH3GL1Q99961 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH3GL1Q99961 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH3GL1Q99961 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH3GL1Q99961 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH3GL1Q99961 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH3GL1Q99961 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH3GL1Q99961 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH3GL1Q99961 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH3GL1Q99961 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH3GL1Q99961 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH3GL1Q99961 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3GL1Q99961 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3GL1Q99961 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3GL1Q99961 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3GL1Q99961 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3GL1Q99961 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3GL1Q99961 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3GL1Q99961 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3GL1Q99961 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH3GL1Q99961 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3GL1Q99961 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3GL1Q99961 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH3GL1Q99961 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH3GL1Q99961 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SH3GL1Q99961 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SH3GL1Q99961 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SH3GL1Q99961 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SH3GL1Q99961 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SH3GL1Q99961 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SH3GL1Q99961 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SH3GL1Q99961 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SH3GL1Q99961 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SH3GL1Q99961 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH3GL1Q99961 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH3GL1Q99961 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH3GL1Q99961 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH3GL1Q99961 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SH3GL1Q99961 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SH3GL1Q99961 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH3GL1Q99961 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH3GL1Q99961 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH3GL1Q99961 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH3GL1Q99961 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH3GL1Q99961 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH3GL1Q99961 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH3GL1Q99961 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3GL1Q99961 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH3GL1Q99961 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH3GL1Q99961 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH3GL1Q99961 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH3GL1Q99961 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH3GL1Q99961 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH3GL1Q99961 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH3GL1Q99961 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3GL1Q99961 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3GL1Q99961 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH3GL1Q99961 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SH3GL1Q99961 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SH3GL1Q99961 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SH3GL1Q99961 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH3GL1Q99961 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH3GL1Q99961 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms