Protein–RNA interactions for Protein: Q96S21

RAB40C, Ras-related protein Rab-40C, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40CQ96S21 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB40CQ96S21 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB40CQ96S21 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB40CQ96S21 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB40CQ96S21 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB40CQ96S21 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB40CQ96S21 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB40CQ96S21 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB40CQ96S21 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB40CQ96S21 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB40CQ96S21 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB40CQ96S21 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB40CQ96S21 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB40CQ96S21 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB40CQ96S21 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB40CQ96S21 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB40CQ96S21 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB40CQ96S21 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB40CQ96S21 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB40CQ96S21 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB40CQ96S21 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB40CQ96S21 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB40CQ96S21 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB40CQ96S21 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB40CQ96S21 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB40CQ96S21 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB40CQ96S21 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB40CQ96S21 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB40CQ96S21 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB40CQ96S21 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB40CQ96S21 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB40CQ96S21 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB40CQ96S21 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB40CQ96S21 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB40CQ96S21 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB40CQ96S21 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB40CQ96S21 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB40CQ96S21 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB40CQ96S21 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB40CQ96S21 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB40CQ96S21 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB40CQ96S21 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB40CQ96S21 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB40CQ96S21 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB40CQ96S21 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB40CQ96S21 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB40CQ96S21 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB40CQ96S21 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB40CQ96S21 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB40CQ96S21 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB40CQ96S21 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB40CQ96S21 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB40CQ96S21 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB40CQ96S21 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB40CQ96S21 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB40CQ96S21 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB40CQ96S21 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB40CQ96S21 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB40CQ96S21 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB40CQ96S21 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB40CQ96S21 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB40CQ96S21 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB40CQ96S21 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB40CQ96S21 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB40CQ96S21 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB40CQ96S21 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB40CQ96S21 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB40CQ96S21 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB40CQ96S21 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB40CQ96S21 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB40CQ96S21 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB40CQ96S21 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB40CQ96S21 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB40CQ96S21 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB40CQ96S21 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB40CQ96S21 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB40CQ96S21 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB40CQ96S21 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB40CQ96S21 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB40CQ96S21 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB40CQ96S21 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB40CQ96S21 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB40CQ96S21 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB40CQ96S21 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB40CQ96S21 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB40CQ96S21 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB40CQ96S21 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB40CQ96S21 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB40CQ96S21 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB40CQ96S21 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB40CQ96S21 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB40CQ96S21 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB40CQ96S21 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB40CQ96S21 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB40CQ96S21 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB40CQ96S21 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB40CQ96S21 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB40CQ96S21 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB40CQ96S21 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB40CQ96S21 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms