Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY7

PTCD3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCD3Q96EY7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTCD3Q96EY7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTCD3Q96EY7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTCD3Q96EY7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTCD3Q96EY7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTCD3Q96EY7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTCD3Q96EY7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTCD3Q96EY7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTCD3Q96EY7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTCD3Q96EY7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PTCD3Q96EY7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTCD3Q96EY7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTCD3Q96EY7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTCD3Q96EY7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTCD3Q96EY7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTCD3Q96EY7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTCD3Q96EY7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTCD3Q96EY7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTCD3Q96EY7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTCD3Q96EY7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTCD3Q96EY7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTCD3Q96EY7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTCD3Q96EY7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTCD3Q96EY7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTCD3Q96EY7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTCD3Q96EY7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTCD3Q96EY7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTCD3Q96EY7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTCD3Q96EY7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTCD3Q96EY7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTCD3Q96EY7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTCD3Q96EY7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTCD3Q96EY7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTCD3Q96EY7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTCD3Q96EY7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTCD3Q96EY7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTCD3Q96EY7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTCD3Q96EY7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTCD3Q96EY7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTCD3Q96EY7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTCD3Q96EY7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTCD3Q96EY7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTCD3Q96EY7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTCD3Q96EY7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTCD3Q96EY7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTCD3Q96EY7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTCD3Q96EY7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PTCD3Q96EY7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTCD3Q96EY7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTCD3Q96EY7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTCD3Q96EY7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTCD3Q96EY7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTCD3Q96EY7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTCD3Q96EY7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTCD3Q96EY7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTCD3Q96EY7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTCD3Q96EY7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTCD3Q96EY7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTCD3Q96EY7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTCD3Q96EY7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTCD3Q96EY7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTCD3Q96EY7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTCD3Q96EY7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTCD3Q96EY7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTCD3Q96EY7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTCD3Q96EY7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTCD3Q96EY7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PTCD3Q96EY7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTCD3Q96EY7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTCD3Q96EY7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTCD3Q96EY7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTCD3Q96EY7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTCD3Q96EY7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTCD3Q96EY7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTCD3Q96EY7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTCD3Q96EY7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTCD3Q96EY7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTCD3Q96EY7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTCD3Q96EY7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTCD3Q96EY7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTCD3Q96EY7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTCD3Q96EY7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PTCD3Q96EY7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTCD3Q96EY7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTCD3Q96EY7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTCD3Q96EY7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTCD3Q96EY7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTCD3Q96EY7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTCD3Q96EY7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTCD3Q96EY7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTCD3Q96EY7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTCD3Q96EY7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTCD3Q96EY7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTCD3Q96EY7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTCD3Q96EY7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTCD3Q96EY7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTCD3Q96EY7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTCD3Q96EY7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTCD3Q96EY7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTCD3Q96EY7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms