Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM63Q969Q1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM63Q969Q1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM63Q969Q1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM63Q969Q1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM63Q969Q1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM63Q969Q1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM63Q969Q1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM63Q969Q1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM63Q969Q1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM63Q969Q1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM63Q969Q1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM63Q969Q1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM63Q969Q1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM63Q969Q1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM63Q969Q1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM63Q969Q1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM63Q969Q1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM63Q969Q1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM63Q969Q1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM63Q969Q1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM63Q969Q1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM63Q969Q1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM63Q969Q1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM63Q969Q1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM63Q969Q1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM63Q969Q1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM63Q969Q1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM63Q969Q1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM63Q969Q1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM63Q969Q1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM63Q969Q1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM63Q969Q1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM63Q969Q1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM63Q969Q1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM63Q969Q1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM63Q969Q1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM63Q969Q1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM63Q969Q1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM63Q969Q1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM63Q969Q1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM63Q969Q1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM63Q969Q1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM63Q969Q1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM63Q969Q1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM63Q969Q1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM63Q969Q1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM63Q969Q1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM63Q969Q1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM63Q969Q1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM63Q969Q1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM63Q969Q1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM63Q969Q1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM63Q969Q1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM63Q969Q1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM63Q969Q1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM63Q969Q1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM63Q969Q1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM63Q969Q1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM63Q969Q1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM63Q969Q1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM63Q969Q1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM63Q969Q1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM63Q969Q1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM63Q969Q1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM63Q969Q1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM63Q969Q1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM63Q969Q1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM63Q969Q1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM63Q969Q1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM63Q969Q1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM63Q969Q1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM63Q969Q1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM63Q969Q1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM63Q969Q1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM63Q969Q1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM63Q969Q1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM63Q969Q1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM63Q969Q1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM63Q969Q1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM63Q969Q1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM63Q969Q1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM63Q969Q1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM63Q969Q1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM63Q969Q1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM63Q969Q1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM63Q969Q1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM63Q969Q1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM63Q969Q1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM63Q969Q1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM63Q969Q1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM63Q969Q1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM63Q969Q1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM63Q969Q1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM63Q969Q1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM63Q969Q1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM63Q969Q1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM63Q969Q1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM63Q969Q1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM63Q969Q1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
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