Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TRIM63Q969Q1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM63Q969Q1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM63Q969Q1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM63Q969Q1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM63Q969Q1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM63Q969Q1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
TRIM63Q969Q1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM63Q969Q1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM63Q969Q1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM63Q969Q1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIM63Q969Q1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM63Q969Q1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM63Q969Q1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM63Q969Q1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM63Q969Q1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM63Q969Q1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM63Q969Q1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM63Q969Q1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRIM63Q969Q1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM63Q969Q1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM63Q969Q1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM63Q969Q1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM63Q969Q1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM63Q969Q1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM63Q969Q1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM63Q969Q1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM63Q969Q1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM63Q969Q1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM63Q969Q1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM63Q969Q1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM63Q969Q1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM63Q969Q1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM63Q969Q1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM63Q969Q1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM63Q969Q1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM63Q969Q1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM63Q969Q1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM63Q969Q1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIM63Q969Q1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM63Q969Q1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM63Q969Q1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM63Q969Q1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM63Q969Q1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM63Q969Q1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM63Q969Q1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM63Q969Q1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM63Q969Q1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM63Q969Q1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM63Q969Q1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM63Q969Q1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM63Q969Q1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM63Q969Q1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM63Q969Q1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM63Q969Q1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM63Q969Q1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM63Q969Q1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM63Q969Q1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM63Q969Q1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM63Q969Q1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM63Q969Q1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM63Q969Q1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM63Q969Q1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM63Q969Q1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM63Q969Q1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM63Q969Q1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM63Q969Q1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM63Q969Q1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM63Q969Q1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM63Q969Q1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM63Q969Q1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM63Q969Q1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM63Q969Q1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM63Q969Q1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM63Q969Q1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM63Q969Q1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM63Q969Q1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM63Q969Q1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM63Q969Q1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM63Q969Q1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM63Q969Q1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM63Q969Q1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM63Q969Q1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM63Q969Q1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM63Q969Q1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM63Q969Q1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM63Q969Q1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM63Q969Q1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM63Q969Q1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM63Q969Q1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM63Q969Q1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM63Q969Q1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM63Q969Q1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM63Q969Q1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM63Q969Q1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM63Q969Q1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM63Q969Q1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM63Q969Q1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM63Q969Q1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM63Q969Q1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
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