Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC107Q8WV48 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC107Q8WV48 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC107Q8WV48 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC107Q8WV48 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC107Q8WV48 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC107Q8WV48 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC107Q8WV48 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC107Q8WV48 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC107Q8WV48 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC107Q8WV48 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC107Q8WV48 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC107Q8WV48 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC107Q8WV48 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC107Q8WV48 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC107Q8WV48 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC107Q8WV48 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC107Q8WV48 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC107Q8WV48 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC107Q8WV48 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC107Q8WV48 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC107Q8WV48 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC107Q8WV48 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC107Q8WV48 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC107Q8WV48 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC107Q8WV48 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC107Q8WV48 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC107Q8WV48 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC107Q8WV48 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC107Q8WV48 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC107Q8WV48 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC107Q8WV48 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC107Q8WV48 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC107Q8WV48 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC107Q8WV48 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC107Q8WV48 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC107Q8WV48 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC107Q8WV48 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC107Q8WV48 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC107Q8WV48 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC107Q8WV48 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC107Q8WV48 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC107Q8WV48 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC107Q8WV48 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC107Q8WV48 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC107Q8WV48 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC107Q8WV48 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC107Q8WV48 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC107Q8WV48 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC107Q8WV48 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC107Q8WV48 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC107Q8WV48 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC107Q8WV48 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC107Q8WV48 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC107Q8WV48 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC107Q8WV48 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC107Q8WV48 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC107Q8WV48 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC107Q8WV48 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC107Q8WV48 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC107Q8WV48 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC107Q8WV48 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC107Q8WV48 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC107Q8WV48 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC107Q8WV48 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC107Q8WV48 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC107Q8WV48 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC107Q8WV48 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC107Q8WV48 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC107Q8WV48 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC107Q8WV48 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC107Q8WV48 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC107Q8WV48 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC107Q8WV48 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC107Q8WV48 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC107Q8WV48 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC107Q8WV48 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC107Q8WV48 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC107Q8WV48 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC107Q8WV48 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC107Q8WV48 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC107Q8WV48 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC107Q8WV48 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC107Q8WV48 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC107Q8WV48 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC107Q8WV48 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC107Q8WV48 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC107Q8WV48 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC107Q8WV48 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC107Q8WV48 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC107Q8WV48 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC107Q8WV48 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC107Q8WV48 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC107Q8WV48 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC107Q8WV48 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC107Q8WV48 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC107Q8WV48 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC107Q8WV48 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC107Q8WV48 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC107Q8WV48 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms