Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD1

RAB2B, Ras-related protein Rab-2B, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2BQ8WUD1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB2BQ8WUD1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB2BQ8WUD1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB2BQ8WUD1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB2BQ8WUD1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB2BQ8WUD1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB2BQ8WUD1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB2BQ8WUD1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB2BQ8WUD1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB2BQ8WUD1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB2BQ8WUD1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB2BQ8WUD1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB2BQ8WUD1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB2BQ8WUD1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAB2BQ8WUD1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAB2BQ8WUD1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB2BQ8WUD1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB2BQ8WUD1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB2BQ8WUD1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB2BQ8WUD1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB2BQ8WUD1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB2BQ8WUD1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB2BQ8WUD1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB2BQ8WUD1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB2BQ8WUD1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB2BQ8WUD1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB2BQ8WUD1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB2BQ8WUD1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB2BQ8WUD1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB2BQ8WUD1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB2BQ8WUD1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB2BQ8WUD1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB2BQ8WUD1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB2BQ8WUD1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB2BQ8WUD1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB2BQ8WUD1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB2BQ8WUD1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB2BQ8WUD1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB2BQ8WUD1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB2BQ8WUD1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB2BQ8WUD1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB2BQ8WUD1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB2BQ8WUD1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB2BQ8WUD1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB2BQ8WUD1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB2BQ8WUD1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB2BQ8WUD1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB2BQ8WUD1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB2BQ8WUD1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB2BQ8WUD1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB2BQ8WUD1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB2BQ8WUD1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB2BQ8WUD1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB2BQ8WUD1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB2BQ8WUD1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB2BQ8WUD1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB2BQ8WUD1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB2BQ8WUD1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB2BQ8WUD1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB2BQ8WUD1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB2BQ8WUD1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB2BQ8WUD1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB2BQ8WUD1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB2BQ8WUD1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAB2BQ8WUD1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAB2BQ8WUD1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB2BQ8WUD1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB2BQ8WUD1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB2BQ8WUD1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB2BQ8WUD1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB2BQ8WUD1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RAB2BQ8WUD1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB2BQ8WUD1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB2BQ8WUD1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB2BQ8WUD1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB2BQ8WUD1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB2BQ8WUD1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB2BQ8WUD1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB2BQ8WUD1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB2BQ8WUD1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB2BQ8WUD1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB2BQ8WUD1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB2BQ8WUD1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB2BQ8WUD1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB2BQ8WUD1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB2BQ8WUD1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB2BQ8WUD1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB2BQ8WUD1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB2BQ8WUD1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB2BQ8WUD1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB2BQ8WUD1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB2BQ8WUD1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB2BQ8WUD1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB2BQ8WUD1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB2BQ8WUD1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB2BQ8WUD1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB2BQ8WUD1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB2BQ8WUD1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB2BQ8WUD1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB2BQ8WUD1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.5 ms