Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI32

LYPD6B, Ly6/PLAUR domain-containing protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD6BQ8NI32 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYPD6BQ8NI32 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYPD6BQ8NI32 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYPD6BQ8NI32 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYPD6BQ8NI32 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LYPD6BQ8NI32 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYPD6BQ8NI32 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYPD6BQ8NI32 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LYPD6BQ8NI32 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LYPD6BQ8NI32 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LYPD6BQ8NI32 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LYPD6BQ8NI32 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LYPD6BQ8NI32 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYPD6BQ8NI32 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LYPD6BQ8NI32 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LYPD6BQ8NI32 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LYPD6BQ8NI32 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LYPD6BQ8NI32 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYPD6BQ8NI32 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYPD6BQ8NI32 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYPD6BQ8NI32 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYPD6BQ8NI32 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYPD6BQ8NI32 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYPD6BQ8NI32 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYPD6BQ8NI32 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYPD6BQ8NI32 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYPD6BQ8NI32 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LYPD6BQ8NI32 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYPD6BQ8NI32 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYPD6BQ8NI32 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYPD6BQ8NI32 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYPD6BQ8NI32 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYPD6BQ8NI32 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYPD6BQ8NI32 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYPD6BQ8NI32 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LYPD6BQ8NI32 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYPD6BQ8NI32 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYPD6BQ8NI32 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYPD6BQ8NI32 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYPD6BQ8NI32 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LYPD6BQ8NI32 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYPD6BQ8NI32 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYPD6BQ8NI32 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYPD6BQ8NI32 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYPD6BQ8NI32 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYPD6BQ8NI32 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYPD6BQ8NI32 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYPD6BQ8NI32 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYPD6BQ8NI32 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYPD6BQ8NI32 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYPD6BQ8NI32 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYPD6BQ8NI32 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYPD6BQ8NI32 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYPD6BQ8NI32 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYPD6BQ8NI32 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYPD6BQ8NI32 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYPD6BQ8NI32 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYPD6BQ8NI32 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYPD6BQ8NI32 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYPD6BQ8NI32 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYPD6BQ8NI32 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYPD6BQ8NI32 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYPD6BQ8NI32 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYPD6BQ8NI32 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LYPD6BQ8NI32 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYPD6BQ8NI32 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYPD6BQ8NI32 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYPD6BQ8NI32 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYPD6BQ8NI32 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYPD6BQ8NI32 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYPD6BQ8NI32 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYPD6BQ8NI32 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYPD6BQ8NI32 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYPD6BQ8NI32 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LYPD6BQ8NI32 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYPD6BQ8NI32 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYPD6BQ8NI32 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYPD6BQ8NI32 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LYPD6BQ8NI32 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LYPD6BQ8NI32 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYPD6BQ8NI32 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYPD6BQ8NI32 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYPD6BQ8NI32 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYPD6BQ8NI32 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYPD6BQ8NI32 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LYPD6BQ8NI32 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LYPD6BQ8NI32 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LYPD6BQ8NI32 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LYPD6BQ8NI32 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LYPD6BQ8NI32 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYPD6BQ8NI32 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYPD6BQ8NI32 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYPD6BQ8NI32 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYPD6BQ8NI32 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYPD6BQ8NI32 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYPD6BQ8NI32 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LYPD6BQ8NI32 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LYPD6BQ8NI32 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYPD6BQ8NI32 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYPD6BQ8NI32 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125 ms