Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDPD1Q8N9F7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDPD1Q8N9F7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDPD1Q8N9F7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDPD1Q8N9F7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDPD1Q8N9F7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDPD1Q8N9F7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDPD1Q8N9F7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDPD1Q8N9F7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDPD1Q8N9F7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDPD1Q8N9F7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDPD1Q8N9F7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDPD1Q8N9F7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDPD1Q8N9F7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GDPD1Q8N9F7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDPD1Q8N9F7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDPD1Q8N9F7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDPD1Q8N9F7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDPD1Q8N9F7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GDPD1Q8N9F7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GDPD1Q8N9F7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GDPD1Q8N9F7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDPD1Q8N9F7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDPD1Q8N9F7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GDPD1Q8N9F7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDPD1Q8N9F7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GDPD1Q8N9F7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GDPD1Q8N9F7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GDPD1Q8N9F7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDPD1Q8N9F7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GDPD1Q8N9F7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GDPD1Q8N9F7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDPD1Q8N9F7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDPD1Q8N9F7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDPD1Q8N9F7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDPD1Q8N9F7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GDPD1Q8N9F7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDPD1Q8N9F7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDPD1Q8N9F7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDPD1Q8N9F7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDPD1Q8N9F7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDPD1Q8N9F7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDPD1Q8N9F7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDPD1Q8N9F7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GDPD1Q8N9F7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GDPD1Q8N9F7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDPD1Q8N9F7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDPD1Q8N9F7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDPD1Q8N9F7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDPD1Q8N9F7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDPD1Q8N9F7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDPD1Q8N9F7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GDPD1Q8N9F7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDPD1Q8N9F7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDPD1Q8N9F7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GDPD1Q8N9F7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDPD1Q8N9F7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDPD1Q8N9F7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDPD1Q8N9F7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDPD1Q8N9F7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDPD1Q8N9F7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GDPD1Q8N9F7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDPD1Q8N9F7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GDPD1Q8N9F7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GDPD1Q8N9F7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDPD1Q8N9F7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDPD1Q8N9F7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDPD1Q8N9F7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDPD1Q8N9F7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDPD1Q8N9F7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDPD1Q8N9F7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDPD1Q8N9F7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GDPD1Q8N9F7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDPD1Q8N9F7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDPD1Q8N9F7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GDPD1Q8N9F7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDPD1Q8N9F7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDPD1Q8N9F7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDPD1Q8N9F7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDPD1Q8N9F7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDPD1Q8N9F7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDPD1Q8N9F7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDPD1Q8N9F7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDPD1Q8N9F7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDPD1Q8N9F7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDPD1Q8N9F7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GDPD1Q8N9F7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDPD1Q8N9F7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GDPD1Q8N9F7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDPD1Q8N9F7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDPD1Q8N9F7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GDPD1Q8N9F7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDPD1Q8N9F7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDPD1Q8N9F7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDPD1Q8N9F7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDPD1Q8N9F7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDPD1Q8N9F7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDPD1Q8N9F7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDPD1Q8N9F7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDPD1Q8N9F7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms