Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7F7

UBL4B, Ubiquitin-like protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4BQ8N7F7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
UBL4BQ8N7F7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
UBL4BQ8N7F7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
UBL4BQ8N7F7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
UBL4BQ8N7F7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
UBL4BQ8N7F7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
UBL4BQ8N7F7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
UBL4BQ8N7F7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
UBL4BQ8N7F7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
UBL4BQ8N7F7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
UBL4BQ8N7F7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
UBL4BQ8N7F7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
UBL4BQ8N7F7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
UBL4BQ8N7F7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
UBL4BQ8N7F7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
UBL4BQ8N7F7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
UBL4BQ8N7F7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
UBL4BQ8N7F7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
UBL4BQ8N7F7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
UBL4BQ8N7F7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
UBL4BQ8N7F7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
UBL4BQ8N7F7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
UBL4BQ8N7F7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
UBL4BQ8N7F7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
UBL4BQ8N7F7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
UBL4BQ8N7F7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBL4BQ8N7F7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
UBL4BQ8N7F7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
UBL4BQ8N7F7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
UBL4BQ8N7F7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
UBL4BQ8N7F7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
UBL4BQ8N7F7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
UBL4BQ8N7F7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
UBL4BQ8N7F7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
UBL4BQ8N7F7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
UBL4BQ8N7F7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
UBL4BQ8N7F7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
UBL4BQ8N7F7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
UBL4BQ8N7F7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
UBL4BQ8N7F7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
UBL4BQ8N7F7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
UBL4BQ8N7F7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
UBL4BQ8N7F7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
UBL4BQ8N7F7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UBL4BQ8N7F7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBL4BQ8N7F7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UBL4BQ8N7F7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
UBL4BQ8N7F7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
UBL4BQ8N7F7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
UBL4BQ8N7F7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
UBL4BQ8N7F7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
UBL4BQ8N7F7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
UBL4BQ8N7F7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
UBL4BQ8N7F7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
UBL4BQ8N7F7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
UBL4BQ8N7F7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
UBL4BQ8N7F7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
UBL4BQ8N7F7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
UBL4BQ8N7F7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
UBL4BQ8N7F7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
UBL4BQ8N7F7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBL4BQ8N7F7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBL4BQ8N7F7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBL4BQ8N7F7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBL4BQ8N7F7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBL4BQ8N7F7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBL4BQ8N7F7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBL4BQ8N7F7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBL4BQ8N7F7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
UBL4BQ8N7F7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBL4BQ8N7F7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBL4BQ8N7F7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBL4BQ8N7F7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBL4BQ8N7F7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBL4BQ8N7F7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UBL4BQ8N7F7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UBL4BQ8N7F7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
UBL4BQ8N7F7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
UBL4BQ8N7F7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
UBL4BQ8N7F7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBL4BQ8N7F7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBL4BQ8N7F7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
UBL4BQ8N7F7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
UBL4BQ8N7F7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
UBL4BQ8N7F7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
UBL4BQ8N7F7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
UBL4BQ8N7F7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
UBL4BQ8N7F7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
UBL4BQ8N7F7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
UBL4BQ8N7F7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
UBL4BQ8N7F7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
UBL4BQ8N7F7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
UBL4BQ8N7F7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UBL4BQ8N7F7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
UBL4BQ8N7F7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
UBL4BQ8N7F7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBL4BQ8N7F7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
UBL4BQ8N7F7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
UBL4BQ8N7F7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
UBL4BQ8N7F7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms