Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYJ1

CPNE9, Copine-9, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE9Q8IYJ1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CPNE9Q8IYJ1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CPNE9Q8IYJ1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CPNE9Q8IYJ1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CPNE9Q8IYJ1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CPNE9Q8IYJ1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CPNE9Q8IYJ1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPNE9Q8IYJ1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPNE9Q8IYJ1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPNE9Q8IYJ1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPNE9Q8IYJ1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CPNE9Q8IYJ1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPNE9Q8IYJ1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CPNE9Q8IYJ1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPNE9Q8IYJ1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPNE9Q8IYJ1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPNE9Q8IYJ1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CPNE9Q8IYJ1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CPNE9Q8IYJ1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CPNE9Q8IYJ1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPNE9Q8IYJ1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CPNE9Q8IYJ1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPNE9Q8IYJ1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPNE9Q8IYJ1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CPNE9Q8IYJ1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CPNE9Q8IYJ1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPNE9Q8IYJ1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CPNE9Q8IYJ1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPNE9Q8IYJ1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPNE9Q8IYJ1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPNE9Q8IYJ1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPNE9Q8IYJ1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPNE9Q8IYJ1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPNE9Q8IYJ1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CPNE9Q8IYJ1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CPNE9Q8IYJ1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPNE9Q8IYJ1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPNE9Q8IYJ1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPNE9Q8IYJ1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPNE9Q8IYJ1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CPNE9Q8IYJ1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CPNE9Q8IYJ1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CPNE9Q8IYJ1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPNE9Q8IYJ1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPNE9Q8IYJ1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPNE9Q8IYJ1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPNE9Q8IYJ1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPNE9Q8IYJ1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPNE9Q8IYJ1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPNE9Q8IYJ1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPNE9Q8IYJ1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPNE9Q8IYJ1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPNE9Q8IYJ1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPNE9Q8IYJ1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPNE9Q8IYJ1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPNE9Q8IYJ1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPNE9Q8IYJ1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPNE9Q8IYJ1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPNE9Q8IYJ1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CPNE9Q8IYJ1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CPNE9Q8IYJ1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CPNE9Q8IYJ1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPNE9Q8IYJ1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPNE9Q8IYJ1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPNE9Q8IYJ1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CPNE9Q8IYJ1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPNE9Q8IYJ1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPNE9Q8IYJ1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPNE9Q8IYJ1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPNE9Q8IYJ1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPNE9Q8IYJ1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPNE9Q8IYJ1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPNE9Q8IYJ1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPNE9Q8IYJ1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPNE9Q8IYJ1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPNE9Q8IYJ1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPNE9Q8IYJ1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPNE9Q8IYJ1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPNE9Q8IYJ1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPNE9Q8IYJ1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPNE9Q8IYJ1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPNE9Q8IYJ1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPNE9Q8IYJ1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CPNE9Q8IYJ1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CPNE9Q8IYJ1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CPNE9Q8IYJ1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CPNE9Q8IYJ1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CPNE9Q8IYJ1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CPNE9Q8IYJ1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CPNE9Q8IYJ1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CPNE9Q8IYJ1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CPNE9Q8IYJ1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CPNE9Q8IYJ1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CPNE9Q8IYJ1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CPNE9Q8IYJ1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CPNE9Q8IYJ1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CPNE9Q8IYJ1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CPNE9Q8IYJ1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CPNE9Q8IYJ1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPNE9Q8IYJ1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms