Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC50Q8IVM0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC50Q8IVM0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC50Q8IVM0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC50Q8IVM0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC50Q8IVM0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC50Q8IVM0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC50Q8IVM0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC50Q8IVM0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC50Q8IVM0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC50Q8IVM0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC50Q8IVM0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC50Q8IVM0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC50Q8IVM0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC50Q8IVM0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC50Q8IVM0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC50Q8IVM0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC50Q8IVM0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC50Q8IVM0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CCDC50Q8IVM0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC50Q8IVM0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC50Q8IVM0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC50Q8IVM0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC50Q8IVM0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC50Q8IVM0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC50Q8IVM0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC50Q8IVM0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC50Q8IVM0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC50Q8IVM0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC50Q8IVM0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC50Q8IVM0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC50Q8IVM0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC50Q8IVM0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC50Q8IVM0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC50Q8IVM0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC50Q8IVM0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC50Q8IVM0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC50Q8IVM0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC50Q8IVM0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC50Q8IVM0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC50Q8IVM0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC50Q8IVM0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC50Q8IVM0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC50Q8IVM0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC50Q8IVM0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC50Q8IVM0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC50Q8IVM0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC50Q8IVM0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC50Q8IVM0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC50Q8IVM0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC50Q8IVM0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC50Q8IVM0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC50Q8IVM0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC50Q8IVM0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC50Q8IVM0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC50Q8IVM0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC50Q8IVM0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC50Q8IVM0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC50Q8IVM0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC50Q8IVM0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC50Q8IVM0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC50Q8IVM0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC50Q8IVM0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC50Q8IVM0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC50Q8IVM0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC50Q8IVM0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC50Q8IVM0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC50Q8IVM0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC50Q8IVM0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC50Q8IVM0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC50Q8IVM0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC50Q8IVM0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC50Q8IVM0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC50Q8IVM0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC50Q8IVM0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC50Q8IVM0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC50Q8IVM0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC50Q8IVM0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC50Q8IVM0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC50Q8IVM0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC50Q8IVM0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC50Q8IVM0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC50Q8IVM0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC50Q8IVM0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC50Q8IVM0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC50Q8IVM0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC50Q8IVM0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC50Q8IVM0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC50Q8IVM0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC50Q8IVM0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC50Q8IVM0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC50Q8IVM0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC50Q8IVM0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC50Q8IVM0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC50Q8IVM0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC50Q8IVM0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC50Q8IVM0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC50Q8IVM0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC50Q8IVM0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC50Q8IVM0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms