Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UFSP1Q6NVU6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UFSP1Q6NVU6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UFSP1Q6NVU6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UFSP1Q6NVU6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UFSP1Q6NVU6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UFSP1Q6NVU6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UFSP1Q6NVU6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UFSP1Q6NVU6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
UFSP1Q6NVU6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UFSP1Q6NVU6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UFSP1Q6NVU6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UFSP1Q6NVU6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UFSP1Q6NVU6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UFSP1Q6NVU6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UFSP1Q6NVU6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UFSP1Q6NVU6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UFSP1Q6NVU6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UFSP1Q6NVU6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
UFSP1Q6NVU6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UFSP1Q6NVU6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UFSP1Q6NVU6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UFSP1Q6NVU6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UFSP1Q6NVU6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
UFSP1Q6NVU6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UFSP1Q6NVU6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
UFSP1Q6NVU6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UFSP1Q6NVU6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
UFSP1Q6NVU6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
UFSP1Q6NVU6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UFSP1Q6NVU6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UFSP1Q6NVU6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UFSP1Q6NVU6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UFSP1Q6NVU6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UFSP1Q6NVU6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UFSP1Q6NVU6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UFSP1Q6NVU6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UFSP1Q6NVU6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UFSP1Q6NVU6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UFSP1Q6NVU6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UFSP1Q6NVU6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UFSP1Q6NVU6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UFSP1Q6NVU6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UFSP1Q6NVU6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UFSP1Q6NVU6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UFSP1Q6NVU6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UFSP1Q6NVU6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UFSP1Q6NVU6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UFSP1Q6NVU6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UFSP1Q6NVU6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UFSP1Q6NVU6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UFSP1Q6NVU6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UFSP1Q6NVU6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UFSP1Q6NVU6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UFSP1Q6NVU6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UFSP1Q6NVU6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UFSP1Q6NVU6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UFSP1Q6NVU6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UFSP1Q6NVU6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UFSP1Q6NVU6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UFSP1Q6NVU6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UFSP1Q6NVU6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UFSP1Q6NVU6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UFSP1Q6NVU6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UFSP1Q6NVU6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UFSP1Q6NVU6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UFSP1Q6NVU6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UFSP1Q6NVU6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UFSP1Q6NVU6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UFSP1Q6NVU6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UFSP1Q6NVU6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UFSP1Q6NVU6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UFSP1Q6NVU6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UFSP1Q6NVU6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UFSP1Q6NVU6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UFSP1Q6NVU6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UFSP1Q6NVU6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UFSP1Q6NVU6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFSP1Q6NVU6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFSP1Q6NVU6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFSP1Q6NVU6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFSP1Q6NVU6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFSP1Q6NVU6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UFSP1Q6NVU6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UFSP1Q6NVU6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UFSP1Q6NVU6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFSP1Q6NVU6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFSP1Q6NVU6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UFSP1Q6NVU6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFSP1Q6NVU6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFSP1Q6NVU6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UFSP1Q6NVU6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UFSP1Q6NVU6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFSP1Q6NVU6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFSP1Q6NVU6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFSP1Q6NVU6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UFSP1Q6NVU6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFSP1Q6NVU6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFSP1Q6NVU6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UFSP1Q6NVU6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms