Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5J6

SWT1, Transcriptional protein SWT1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWT1Q5T5J6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SWT1Q5T5J6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SWT1Q5T5J6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SWT1Q5T5J6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SWT1Q5T5J6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SWT1Q5T5J6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SWT1Q5T5J6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SWT1Q5T5J6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SWT1Q5T5J6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SWT1Q5T5J6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SWT1Q5T5J6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SWT1Q5T5J6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SWT1Q5T5J6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SWT1Q5T5J6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SWT1Q5T5J6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SWT1Q5T5J6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SWT1Q5T5J6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SWT1Q5T5J6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SWT1Q5T5J6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SWT1Q5T5J6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SWT1Q5T5J6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SWT1Q5T5J6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SWT1Q5T5J6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SWT1Q5T5J6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SWT1Q5T5J6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SWT1Q5T5J6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SWT1Q5T5J6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SWT1Q5T5J6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SWT1Q5T5J6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SWT1Q5T5J6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SWT1Q5T5J6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SWT1Q5T5J6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SWT1Q5T5J6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SWT1Q5T5J6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SWT1Q5T5J6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SWT1Q5T5J6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SWT1Q5T5J6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SWT1Q5T5J6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SWT1Q5T5J6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SWT1Q5T5J6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SWT1Q5T5J6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SWT1Q5T5J6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SWT1Q5T5J6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SWT1Q5T5J6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SWT1Q5T5J6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SWT1Q5T5J6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SWT1Q5T5J6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SWT1Q5T5J6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SWT1Q5T5J6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SWT1Q5T5J6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SWT1Q5T5J6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SWT1Q5T5J6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SWT1Q5T5J6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SWT1Q5T5J6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SWT1Q5T5J6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SWT1Q5T5J6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SWT1Q5T5J6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SWT1Q5T5J6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SWT1Q5T5J6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SWT1Q5T5J6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SWT1Q5T5J6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SWT1Q5T5J6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SWT1Q5T5J6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SWT1Q5T5J6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SWT1Q5T5J6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SWT1Q5T5J6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SWT1Q5T5J6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SWT1Q5T5J6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SWT1Q5T5J6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SWT1Q5T5J6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SWT1Q5T5J6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SWT1Q5T5J6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SWT1Q5T5J6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SWT1Q5T5J6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SWT1Q5T5J6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SWT1Q5T5J6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SWT1Q5T5J6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SWT1Q5T5J6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SWT1Q5T5J6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SWT1Q5T5J6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SWT1Q5T5J6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SWT1Q5T5J6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SWT1Q5T5J6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SWT1Q5T5J6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SWT1Q5T5J6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SWT1Q5T5J6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SWT1Q5T5J6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SWT1Q5T5J6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SWT1Q5T5J6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SWT1Q5T5J6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SWT1Q5T5J6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SWT1Q5T5J6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SWT1Q5T5J6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SWT1Q5T5J6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SWT1Q5T5J6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SWT1Q5T5J6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SWT1Q5T5J6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SWT1Q5T5J6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SWT1Q5T5J6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SWT1Q5T5J6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms