Protein–RNA interactions for Protein: Q53GA4

PHLDA2, Pleckstrin homology-like domain family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA2Q53GA4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHLDA2Q53GA4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHLDA2Q53GA4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHLDA2Q53GA4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHLDA2Q53GA4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHLDA2Q53GA4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHLDA2Q53GA4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHLDA2Q53GA4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHLDA2Q53GA4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHLDA2Q53GA4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHLDA2Q53GA4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHLDA2Q53GA4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHLDA2Q53GA4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHLDA2Q53GA4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHLDA2Q53GA4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHLDA2Q53GA4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHLDA2Q53GA4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHLDA2Q53GA4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHLDA2Q53GA4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHLDA2Q53GA4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHLDA2Q53GA4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHLDA2Q53GA4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHLDA2Q53GA4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHLDA2Q53GA4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHLDA2Q53GA4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHLDA2Q53GA4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHLDA2Q53GA4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHLDA2Q53GA4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHLDA2Q53GA4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHLDA2Q53GA4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHLDA2Q53GA4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHLDA2Q53GA4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHLDA2Q53GA4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHLDA2Q53GA4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHLDA2Q53GA4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHLDA2Q53GA4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHLDA2Q53GA4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHLDA2Q53GA4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHLDA2Q53GA4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHLDA2Q53GA4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHLDA2Q53GA4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHLDA2Q53GA4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHLDA2Q53GA4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHLDA2Q53GA4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHLDA2Q53GA4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHLDA2Q53GA4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHLDA2Q53GA4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHLDA2Q53GA4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHLDA2Q53GA4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHLDA2Q53GA4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHLDA2Q53GA4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHLDA2Q53GA4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHLDA2Q53GA4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHLDA2Q53GA4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHLDA2Q53GA4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHLDA2Q53GA4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHLDA2Q53GA4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHLDA2Q53GA4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHLDA2Q53GA4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHLDA2Q53GA4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHLDA2Q53GA4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHLDA2Q53GA4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHLDA2Q53GA4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHLDA2Q53GA4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHLDA2Q53GA4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHLDA2Q53GA4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHLDA2Q53GA4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHLDA2Q53GA4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHLDA2Q53GA4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHLDA2Q53GA4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHLDA2Q53GA4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHLDA2Q53GA4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHLDA2Q53GA4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHLDA2Q53GA4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHLDA2Q53GA4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHLDA2Q53GA4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHLDA2Q53GA4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHLDA2Q53GA4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHLDA2Q53GA4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHLDA2Q53GA4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHLDA2Q53GA4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHLDA2Q53GA4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHLDA2Q53GA4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHLDA2Q53GA4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHLDA2Q53GA4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PHLDA2Q53GA4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHLDA2Q53GA4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHLDA2Q53GA4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHLDA2Q53GA4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHLDA2Q53GA4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHLDA2Q53GA4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHLDA2Q53GA4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHLDA2Q53GA4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHLDA2Q53GA4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHLDA2Q53GA4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHLDA2Q53GA4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHLDA2Q53GA4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHLDA2Q53GA4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHLDA2Q53GA4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHLDA2Q53GA4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms