Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP6Q3SY56 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP6Q3SY56 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP6Q3SY56 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SP6Q3SY56 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP6Q3SY56 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SP6Q3SY56 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SP6Q3SY56 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SP6Q3SY56 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SP6Q3SY56 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SP6Q3SY56 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SP6Q3SY56 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SP6Q3SY56 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SP6Q3SY56 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SP6Q3SY56 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SP6Q3SY56 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SP6Q3SY56 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SP6Q3SY56 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SP6Q3SY56 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SP6Q3SY56 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SP6Q3SY56 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SP6Q3SY56 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SP6Q3SY56 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SP6Q3SY56 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SP6Q3SY56 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SP6Q3SY56 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP6Q3SY56 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP6Q3SY56 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP6Q3SY56 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SP6Q3SY56 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SP6Q3SY56 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP6Q3SY56 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SP6Q3SY56 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SP6Q3SY56 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP6Q3SY56 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP6Q3SY56 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP6Q3SY56 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP6Q3SY56 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP6Q3SY56 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP6Q3SY56 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP6Q3SY56 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP6Q3SY56 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP6Q3SY56 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP6Q3SY56 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP6Q3SY56 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SP6Q3SY56 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP6Q3SY56 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SP6Q3SY56 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SP6Q3SY56 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SP6Q3SY56 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SP6Q3SY56 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SP6Q3SY56 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SP6Q3SY56 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SP6Q3SY56 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP6Q3SY56 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP6Q3SY56 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SP6Q3SY56 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SP6Q3SY56 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SP6Q3SY56 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SP6Q3SY56 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP6Q3SY56 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP6Q3SY56 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP6Q3SY56 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SP6Q3SY56 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SP6Q3SY56 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SP6Q3SY56 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SP6Q3SY56 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP6Q3SY56 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP6Q3SY56 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP6Q3SY56 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP6Q3SY56 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP6Q3SY56 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP6Q3SY56 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP6Q3SY56 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP6Q3SY56 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP6Q3SY56 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP6Q3SY56 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP6Q3SY56 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP6Q3SY56 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP6Q3SY56 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP6Q3SY56 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP6Q3SY56 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP6Q3SY56 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP6Q3SY56 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP6Q3SY56 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP6Q3SY56 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP6Q3SY56 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP6Q3SY56 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP6Q3SY56 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP6Q3SY56 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP6Q3SY56 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SP6Q3SY56 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP6Q3SY56 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP6Q3SY56 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP6Q3SY56 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP6Q3SY56 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP6Q3SY56 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP6Q3SY56 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SP6Q3SY56 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP6Q3SY56 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms