Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAM2Q15035 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAM2Q15035 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAM2Q15035 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAM2Q15035 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAM2Q15035 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAM2Q15035 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAM2Q15035 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAM2Q15035 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAM2Q15035 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAM2Q15035 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAM2Q15035 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAM2Q15035 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAM2Q15035 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAM2Q15035 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAM2Q15035 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAM2Q15035 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAM2Q15035 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAM2Q15035 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAM2Q15035 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAM2Q15035 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAM2Q15035 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAM2Q15035 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAM2Q15035 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAM2Q15035 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAM2Q15035 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAM2Q15035 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAM2Q15035 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAM2Q15035 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAM2Q15035 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAM2Q15035 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAM2Q15035 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAM2Q15035 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAM2Q15035 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAM2Q15035 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAM2Q15035 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAM2Q15035 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAM2Q15035 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAM2Q15035 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAM2Q15035 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAM2Q15035 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAM2Q15035 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAM2Q15035 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAM2Q15035 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAM2Q15035 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAM2Q15035 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAM2Q15035 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAM2Q15035 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAM2Q15035 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAM2Q15035 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAM2Q15035 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAM2Q15035 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAM2Q15035 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAM2Q15035 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAM2Q15035 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAM2Q15035 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAM2Q15035 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAM2Q15035 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAM2Q15035 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAM2Q15035 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAM2Q15035 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAM2Q15035 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAM2Q15035 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAM2Q15035 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAM2Q15035 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAM2Q15035 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAM2Q15035 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAM2Q15035 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAM2Q15035 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAM2Q15035 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAM2Q15035 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAM2Q15035 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAM2Q15035 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAM2Q15035 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAM2Q15035 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAM2Q15035 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAM2Q15035 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAM2Q15035 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRAM2Q15035 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRAM2Q15035 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAM2Q15035 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAM2Q15035 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAM2Q15035 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAM2Q15035 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAM2Q15035 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAM2Q15035 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAM2Q15035 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRAM2Q15035 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAM2Q15035 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAM2Q15035 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAM2Q15035 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAM2Q15035 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAM2Q15035 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAM2Q15035 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAM2Q15035 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAM2Q15035 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAM2Q15035 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAM2Q15035 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAM2Q15035 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAM2Q15035 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
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