Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CIRBPQ14011 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CIRBPQ14011 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CIRBPQ14011 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CIRBPQ14011 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CIRBPQ14011 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CIRBPQ14011 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CIRBPQ14011 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CIRBPQ14011 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CIRBPQ14011 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CIRBPQ14011 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CIRBPQ14011 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CIRBPQ14011 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CIRBPQ14011 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CIRBPQ14011 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CIRBPQ14011 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CIRBPQ14011 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CIRBPQ14011 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CIRBPQ14011 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CIRBPQ14011 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CIRBPQ14011 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CIRBPQ14011 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CIRBPQ14011 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CIRBPQ14011 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CIRBPQ14011 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CIRBPQ14011 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CIRBPQ14011 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CIRBPQ14011 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CIRBPQ14011 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CIRBPQ14011 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CIRBPQ14011 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CIRBPQ14011 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CIRBPQ14011 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CIRBPQ14011 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CIRBPQ14011 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CIRBPQ14011 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CIRBPQ14011 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CIRBPQ14011 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CIRBPQ14011 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CIRBPQ14011 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CIRBPQ14011 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CIRBPQ14011 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CIRBPQ14011 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CIRBPQ14011 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CIRBPQ14011 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CIRBPQ14011 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CIRBPQ14011 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CIRBPQ14011 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CIRBPQ14011 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CIRBPQ14011 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CIRBPQ14011 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CIRBPQ14011 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CIRBPQ14011 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CIRBPQ14011 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CIRBPQ14011 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CIRBPQ14011 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CIRBPQ14011 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CIRBPQ14011 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CIRBPQ14011 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CIRBPQ14011 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CIRBPQ14011 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CIRBPQ14011 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CIRBPQ14011 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CIRBPQ14011 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CIRBPQ14011 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CIRBPQ14011 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CIRBPQ14011 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CIRBPQ14011 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CIRBPQ14011 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CIRBPQ14011 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CIRBPQ14011 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CIRBPQ14011 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CIRBPQ14011 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CIRBPQ14011 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CIRBPQ14011 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CIRBPQ14011 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CIRBPQ14011 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CIRBPQ14011 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CIRBPQ14011 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CIRBPQ14011 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CIRBPQ14011 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CIRBPQ14011 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CIRBPQ14011 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CIRBPQ14011 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CIRBPQ14011 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CIRBPQ14011 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CIRBPQ14011 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CIRBPQ14011 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CIRBPQ14011 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CIRBPQ14011 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CIRBPQ14011 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CIRBPQ14011 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CIRBPQ14011 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CIRBPQ14011 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CIRBPQ14011 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CIRBPQ14011 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CIRBPQ14011 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CIRBPQ14011 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CIRBPQ14011 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CIRBPQ14011 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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