Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN1BQ07699 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN1BQ07699 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN1BQ07699 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN1BQ07699 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCN1BQ07699 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN1BQ07699 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN1BQ07699 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN1BQ07699 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN1BQ07699 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN1BQ07699 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN1BQ07699 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN1BQ07699 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN1BQ07699 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN1BQ07699 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN1BQ07699 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN1BQ07699 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN1BQ07699 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN1BQ07699 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN1BQ07699 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN1BQ07699 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN1BQ07699 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN1BQ07699 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN1BQ07699 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCN1BQ07699 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN1BQ07699 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCN1BQ07699 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCN1BQ07699 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN1BQ07699 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCN1BQ07699 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN1BQ07699 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN1BQ07699 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN1BQ07699 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN1BQ07699 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN1BQ07699 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN1BQ07699 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN1BQ07699 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN1BQ07699 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN1BQ07699 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN1BQ07699 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN1BQ07699 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN1BQ07699 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN1BQ07699 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN1BQ07699 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN1BQ07699 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN1BQ07699 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN1BQ07699 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN1BQ07699 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN1BQ07699 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN1BQ07699 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN1BQ07699 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN1BQ07699 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN1BQ07699 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN1BQ07699 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN1BQ07699 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN1BQ07699 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN1BQ07699 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN1BQ07699 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN1BQ07699 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN1BQ07699 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN1BQ07699 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN1BQ07699 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN1BQ07699 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN1BQ07699 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN1BQ07699 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN1BQ07699 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN1BQ07699 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN1BQ07699 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN1BQ07699 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN1BQ07699 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN1BQ07699 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN1BQ07699 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN1BQ07699 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN1BQ07699 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN1BQ07699 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN1BQ07699 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN1BQ07699 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN1BQ07699 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN1BQ07699 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN1BQ07699 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN1BQ07699 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN1BQ07699 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN1BQ07699 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN1BQ07699 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN1BQ07699 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN1BQ07699 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN1BQ07699 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN1BQ07699 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN1BQ07699 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN1BQ07699 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN1BQ07699 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN1BQ07699 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN1BQ07699 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCN1BQ07699 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCN1BQ07699 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCN1BQ07699 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCN1BQ07699 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN1BQ07699 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN1BQ07699 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCN1BQ07699 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms