Protein–RNA interactions for Protein: P80162

CXCL6, C-X-C motif chemokine 6, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL6P80162 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CXCL6P80162 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL6P80162 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL6P80162 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL6P80162 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL6P80162 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL6P80162 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL6P80162 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL6P80162 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL6P80162 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL6P80162 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL6P80162 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL6P80162 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL6P80162 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL6P80162 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL6P80162 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL6P80162 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL6P80162 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL6P80162 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL6P80162 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL6P80162 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL6P80162 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL6P80162 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL6P80162 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL6P80162 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL6P80162 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL6P80162 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL6P80162 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL6P80162 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL6P80162 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CXCL6P80162 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL6P80162 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL6P80162 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL6P80162 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL6P80162 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL6P80162 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL6P80162 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL6P80162 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL6P80162 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL6P80162 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL6P80162 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CXCL6P80162 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL6P80162 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL6P80162 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL6P80162 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL6P80162 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL6P80162 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL6P80162 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL6P80162 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL6P80162 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL6P80162 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL6P80162 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL6P80162 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CXCL6P80162 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CXCL6P80162 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CXCL6P80162 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CXCL6P80162 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CXCL6P80162 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CXCL6P80162 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCL6P80162 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCL6P80162 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL6P80162 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL6P80162 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL6P80162 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL6P80162 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL6P80162 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CXCL6P80162 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CXCL6P80162 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CXCL6P80162 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CXCL6P80162 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CXCL6P80162 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CXCL6P80162 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CXCL6P80162 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL6P80162 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CXCL6P80162 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CXCL6P80162 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL6P80162 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL6P80162 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL6P80162 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CXCL6P80162 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CXCL6P80162 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL6P80162 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CXCL6P80162 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL6P80162 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL6P80162 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CXCL6P80162 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CXCL6P80162 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL6P80162 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL6P80162 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCL6P80162 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL6P80162 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL6P80162 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL6P80162 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCL6P80162 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL6P80162 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL6P80162 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCL6P80162 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL6P80162 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL6P80162 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CXCL6P80162 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms