Protein–RNA interactions for Protein: P68036

UBE2L3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2L3P68036 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2L3P68036 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2L3P68036 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2L3P68036 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2L3P68036 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2L3P68036 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2L3P68036 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2L3P68036 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2L3P68036 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2L3P68036 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2L3P68036 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2L3P68036 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2L3P68036 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2L3P68036 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2L3P68036 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2L3P68036 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2L3P68036 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2L3P68036 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2L3P68036 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2L3P68036 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2L3P68036 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2L3P68036 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2L3P68036 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2L3P68036 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2L3P68036 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2L3P68036 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2L3P68036 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2L3P68036 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2L3P68036 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2L3P68036 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2L3P68036 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2L3P68036 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBE2L3P68036 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2L3P68036 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2L3P68036 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2L3P68036 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2L3P68036 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2L3P68036 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2L3P68036 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBE2L3P68036 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2L3P68036 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2L3P68036 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2L3P68036 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2L3P68036 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2L3P68036 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2L3P68036 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2L3P68036 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2L3P68036 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2L3P68036 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2L3P68036 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2L3P68036 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2L3P68036 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2L3P68036 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE2L3P68036 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE2L3P68036 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2L3P68036 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2L3P68036 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2L3P68036 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2L3P68036 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBE2L3P68036 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2L3P68036 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2L3P68036 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2L3P68036 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2L3P68036 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2L3P68036 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2L3P68036 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2L3P68036 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2L3P68036 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2L3P68036 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2L3P68036 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2L3P68036 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2L3P68036 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2L3P68036 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2L3P68036 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBE2L3P68036 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2L3P68036 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2L3P68036 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2L3P68036 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2L3P68036 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2L3P68036 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2L3P68036 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2L3P68036 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2L3P68036 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2L3P68036 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2L3P68036 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2L3P68036 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2L3P68036 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2L3P68036 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2L3P68036 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2L3P68036 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2L3P68036 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2L3P68036 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE2L3P68036 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE2L3P68036 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2L3P68036 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2L3P68036 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2L3P68036 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2L3P68036 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2L3P68036 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBE2L3P68036 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms