Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ELLP55199 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELLP55199 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ELLP55199 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELLP55199 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELLP55199 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELLP55199 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELLP55199 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ELLP55199 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ELLP55199 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ELLP55199 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELLP55199 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELLP55199 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELLP55199 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELLP55199 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ELLP55199 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ELLP55199 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ELLP55199 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ELLP55199 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELLP55199 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELLP55199 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELLP55199 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELLP55199 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELLP55199 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELLP55199 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELLP55199 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELLP55199 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELLP55199 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ELLP55199 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ELLP55199 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ELLP55199 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELLP55199 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELLP55199 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELLP55199 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELLP55199 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELLP55199 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ELLP55199 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ELLP55199 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ELLP55199 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ELLP55199 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ELLP55199 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ELLP55199 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELLP55199 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELLP55199 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELLP55199 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ELLP55199 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ELLP55199 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELLP55199 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELLP55199 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELLP55199 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELLP55199 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ELLP55199 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ELLP55199 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELLP55199 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELLP55199 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELLP55199 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELLP55199 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELLP55199 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELLP55199 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELLP55199 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELLP55199 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELLP55199 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELLP55199 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELLP55199 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELLP55199 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELLP55199 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELLP55199 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELLP55199 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ELLP55199 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ELLP55199 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ELLP55199 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ELLP55199 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ELLP55199 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ELLP55199 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ELLP55199 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ELLP55199 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ELLP55199 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ELLP55199 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ELLP55199 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ELLP55199 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELLP55199 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELLP55199 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELLP55199 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELLP55199 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELLP55199 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELLP55199 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELLP55199 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELLP55199 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ELLP55199 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ELLP55199 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ELLP55199 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELLP55199 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELLP55199 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELLP55199 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ELLP55199 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELLP55199 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELLP55199 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELLP55199 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELLP55199 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELLP55199 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms