Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKAA2P54646 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKAA2P54646 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKAA2P54646 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKAA2P54646 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKAA2P54646 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKAA2P54646 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKAA2P54646 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKAA2P54646 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKAA2P54646 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKAA2P54646 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKAA2P54646 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKAA2P54646 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKAA2P54646 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRKAA2P54646 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRKAA2P54646 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKAA2P54646 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKAA2P54646 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKAA2P54646 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKAA2P54646 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKAA2P54646 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKAA2P54646 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKAA2P54646 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKAA2P54646 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKAA2P54646 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKAA2P54646 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKAA2P54646 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKAA2P54646 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKAA2P54646 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKAA2P54646 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRKAA2P54646 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRKAA2P54646 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRKAA2P54646 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRKAA2P54646 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKAA2P54646 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKAA2P54646 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRKAA2P54646 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKAA2P54646 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKAA2P54646 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKAA2P54646 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKAA2P54646 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKAA2P54646 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKAA2P54646 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKAA2P54646 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRKAA2P54646 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRKAA2P54646 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKAA2P54646 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKAA2P54646 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKAA2P54646 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKAA2P54646 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRKAA2P54646 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRKAA2P54646 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRKAA2P54646 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKAA2P54646 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKAA2P54646 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKAA2P54646 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKAA2P54646 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRKAA2P54646 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKAA2P54646 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKAA2P54646 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKAA2P54646 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRKAA2P54646 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKAA2P54646 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRKAA2P54646 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKAA2P54646 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRKAA2P54646 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKAA2P54646 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKAA2P54646 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKAA2P54646 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKAA2P54646 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKAA2P54646 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKAA2P54646 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRKAA2P54646 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRKAA2P54646 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRKAA2P54646 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRKAA2P54646 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKAA2P54646 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRKAA2P54646 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKAA2P54646 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRKAA2P54646 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRKAA2P54646 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRKAA2P54646 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRKAA2P54646 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRKAA2P54646 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKAA2P54646 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKAA2P54646 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKAA2P54646 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKAA2P54646 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRKAA2P54646 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRKAA2P54646 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRKAA2P54646 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKAA2P54646 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKAA2P54646 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKAA2P54646 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKAA2P54646 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKAA2P54646 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKAA2P54646 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKAA2P54646 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKAA2P54646 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRKAA2P54646 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms