Protein–RNA interactions for Protein: P53990

IST1, IST1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IST1P53990 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IST1P53990 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IST1P53990 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IST1P53990 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IST1P53990 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IST1P53990 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IST1P53990 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
IST1P53990 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
IST1P53990 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27■■□□□ 1.91
IST1P53990 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IST1P53990 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IST1P53990 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IST1P53990 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IST1P53990 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
IST1P53990 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IST1P53990 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IST1P53990 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IST1P53990 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IST1P53990 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IST1P53990 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IST1P53990 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IST1P53990 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IST1P53990 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IST1P53990 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IST1P53990 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
IST1P53990 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IST1P53990 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IST1P53990 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IST1P53990 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IST1P53990 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IST1P53990 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IST1P53990 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IST1P53990 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IST1P53990 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IST1P53990 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IST1P53990 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IST1P53990 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IST1P53990 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IST1P53990 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IST1P53990 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IST1P53990 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IST1P53990 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IST1P53990 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IST1P53990 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IST1P53990 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
IST1P53990 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
IST1P53990 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IST1P53990 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IST1P53990 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IST1P53990 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IST1P53990 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IST1P53990 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IST1P53990 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IST1P53990 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IST1P53990 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IST1P53990 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IST1P53990 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IST1P53990 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IST1P53990 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IST1P53990 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IST1P53990 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IST1P53990 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IST1P53990 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IST1P53990 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IST1P53990 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IST1P53990 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IST1P53990 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IST1P53990 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IST1P53990 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IST1P53990 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IST1P53990 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IST1P53990 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IST1P53990 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IST1P53990 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IST1P53990 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IST1P53990 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IST1P53990 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IST1P53990 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
IST1P53990 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IST1P53990 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IST1P53990 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IST1P53990 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IST1P53990 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IST1P53990 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IST1P53990 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IST1P53990 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IST1P53990 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IST1P53990 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IST1P53990 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IST1P53990 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
IST1P53990 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IST1P53990 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IST1P53990 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IST1P53990 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IST1P53990 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IST1P53990 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IST1P53990 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IST1P53990 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IST1P53990 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IST1P53990 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms