Protein–RNA interactions for Protein: P50395

GDI2, Rab GDP dissociation inhibitor beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI2P50395 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GDI2P50395 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GDI2P50395 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GDI2P50395 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GDI2P50395 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDI2P50395 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GDI2P50395 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GDI2P50395 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDI2P50395 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDI2P50395 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDI2P50395 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDI2P50395 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDI2P50395 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDI2P50395 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDI2P50395 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDI2P50395 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDI2P50395 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDI2P50395 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDI2P50395 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDI2P50395 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GDI2P50395 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDI2P50395 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDI2P50395 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDI2P50395 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDI2P50395 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDI2P50395 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDI2P50395 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDI2P50395 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDI2P50395 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDI2P50395 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDI2P50395 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDI2P50395 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDI2P50395 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDI2P50395 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDI2P50395 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDI2P50395 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GDI2P50395 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDI2P50395 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDI2P50395 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDI2P50395 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDI2P50395 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDI2P50395 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDI2P50395 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDI2P50395 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDI2P50395 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDI2P50395 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GDI2P50395 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDI2P50395 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDI2P50395 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDI2P50395 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDI2P50395 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDI2P50395 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDI2P50395 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDI2P50395 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDI2P50395 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GDI2P50395 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GDI2P50395 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDI2P50395 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDI2P50395 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDI2P50395 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GDI2P50395 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GDI2P50395 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GDI2P50395 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GDI2P50395 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDI2P50395 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GDI2P50395 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDI2P50395 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDI2P50395 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GDI2P50395 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GDI2P50395 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GDI2P50395 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GDI2P50395 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GDI2P50395 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDI2P50395 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDI2P50395 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDI2P50395 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDI2P50395 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDI2P50395 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDI2P50395 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDI2P50395 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDI2P50395 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDI2P50395 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDI2P50395 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDI2P50395 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDI2P50395 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDI2P50395 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDI2P50395 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDI2P50395 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDI2P50395 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDI2P50395 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDI2P50395 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDI2P50395 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDI2P50395 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDI2P50395 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDI2P50395 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDI2P50395 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDI2P50395 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDI2P50395 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDI2P50395 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDI2P50395 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms