Protein–RNA interactions for Protein: P49746

THBS3, Thrombospondin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3P49746 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THBS3P49746 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
THBS3P49746 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THBS3P49746 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THBS3P49746 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THBS3P49746 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
THBS3P49746 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THBS3P49746 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THBS3P49746 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THBS3P49746 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THBS3P49746 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THBS3P49746 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THBS3P49746 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THBS3P49746 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THBS3P49746 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THBS3P49746 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THBS3P49746 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THBS3P49746 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THBS3P49746 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THBS3P49746 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
THBS3P49746 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THBS3P49746 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THBS3P49746 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THBS3P49746 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THBS3P49746 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THBS3P49746 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
THBS3P49746 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
THBS3P49746 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
THBS3P49746 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THBS3P49746 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
THBS3P49746 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
THBS3P49746 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THBS3P49746 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
THBS3P49746 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
THBS3P49746 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THBS3P49746 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THBS3P49746 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THBS3P49746 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THBS3P49746 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
THBS3P49746 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
THBS3P49746 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THBS3P49746 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THBS3P49746 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THBS3P49746 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THBS3P49746 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THBS3P49746 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THBS3P49746 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
THBS3P49746 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
THBS3P49746 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
THBS3P49746 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
THBS3P49746 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
THBS3P49746 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
THBS3P49746 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
THBS3P49746 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THBS3P49746 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THBS3P49746 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THBS3P49746 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THBS3P49746 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THBS3P49746 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THBS3P49746 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THBS3P49746 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THBS3P49746 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THBS3P49746 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THBS3P49746 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THBS3P49746 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THBS3P49746 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
THBS3P49746 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THBS3P49746 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THBS3P49746 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THBS3P49746 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THBS3P49746 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THBS3P49746 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THBS3P49746 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THBS3P49746 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
THBS3P49746 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THBS3P49746 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THBS3P49746 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THBS3P49746 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THBS3P49746 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THBS3P49746 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THBS3P49746 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THBS3P49746 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THBS3P49746 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THBS3P49746 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THBS3P49746 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THBS3P49746 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THBS3P49746 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THBS3P49746 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THBS3P49746 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THBS3P49746 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THBS3P49746 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THBS3P49746 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THBS3P49746 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THBS3P49746 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THBS3P49746 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THBS3P49746 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THBS3P49746 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THBS3P49746 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THBS3P49746 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THBS3P49746 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms