Protein–RNA interactions for Protein: P49746

THBS3, Thrombospondin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3P49746 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
THBS3P49746 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
THBS3P49746 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
THBS3P49746 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
THBS3P49746 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
THBS3P49746 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
THBS3P49746 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
THBS3P49746 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
THBS3P49746 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
THBS3P49746 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
THBS3P49746 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
THBS3P49746 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
THBS3P49746 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
THBS3P49746 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
THBS3P49746 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
THBS3P49746 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
THBS3P49746 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
THBS3P49746 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
THBS3P49746 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
THBS3P49746 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
THBS3P49746 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
THBS3P49746 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
THBS3P49746 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
THBS3P49746 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
THBS3P49746 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
THBS3P49746 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
THBS3P49746 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
THBS3P49746 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
THBS3P49746 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
THBS3P49746 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
THBS3P49746 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
THBS3P49746 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
THBS3P49746 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
THBS3P49746 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
THBS3P49746 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
THBS3P49746 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
THBS3P49746 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
THBS3P49746 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
THBS3P49746 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THBS3P49746 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THBS3P49746 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
THBS3P49746 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THBS3P49746 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THBS3P49746 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
THBS3P49746 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THBS3P49746 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THBS3P49746 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THBS3P49746 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THBS3P49746 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THBS3P49746 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THBS3P49746 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THBS3P49746 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THBS3P49746 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THBS3P49746 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THBS3P49746 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THBS3P49746 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THBS3P49746 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THBS3P49746 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THBS3P49746 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THBS3P49746 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THBS3P49746 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THBS3P49746 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THBS3P49746 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THBS3P49746 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THBS3P49746 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
THBS3P49746 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
THBS3P49746 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
THBS3P49746 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
THBS3P49746 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
THBS3P49746 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
THBS3P49746 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
THBS3P49746 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THBS3P49746 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THBS3P49746 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THBS3P49746 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THBS3P49746 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
THBS3P49746 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
THBS3P49746 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
THBS3P49746 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
THBS3P49746 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
THBS3P49746 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
THBS3P49746 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
THBS3P49746 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
THBS3P49746 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
THBS3P49746 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THBS3P49746 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THBS3P49746 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THBS3P49746 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
THBS3P49746 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THBS3P49746 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THBS3P49746 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THBS3P49746 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
THBS3P49746 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THBS3P49746 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THBS3P49746 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
THBS3P49746 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THBS3P49746 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THBS3P49746 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THBS3P49746 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THBS3P49746 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms