Protein–RNA interactions for Protein: P48431

SOX2, Transcription factor SOX-2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX2P48431 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX2P48431 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX2P48431 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX2P48431 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX2P48431 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX2P48431 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX2P48431 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SOX2P48431 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX2P48431 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX2P48431 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX2P48431 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX2P48431 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX2P48431 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX2P48431 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX2P48431 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX2P48431 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX2P48431 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX2P48431 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX2P48431 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX2P48431 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX2P48431 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX2P48431 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOX2P48431 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SOX2P48431 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX2P48431 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX2P48431 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX2P48431 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX2P48431 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX2P48431 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX2P48431 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX2P48431 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX2P48431 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX2P48431 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX2P48431 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX2P48431 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX2P48431 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SOX2P48431 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX2P48431 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX2P48431 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX2P48431 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX2P48431 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX2P48431 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX2P48431 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX2P48431 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX2P48431 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX2P48431 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX2P48431 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX2P48431 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX2P48431 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX2P48431 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX2P48431 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX2P48431 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX2P48431 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX2P48431 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX2P48431 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX2P48431 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX2P48431 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX2P48431 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX2P48431 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX2P48431 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX2P48431 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SOX2P48431 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX2P48431 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX2P48431 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX2P48431 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX2P48431 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX2P48431 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX2P48431 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX2P48431 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX2P48431 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX2P48431 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOX2P48431 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SOX2P48431 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX2P48431 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX2P48431 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX2P48431 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOX2P48431 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX2P48431 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX2P48431 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SOX2P48431 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX2P48431 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX2P48431 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX2P48431 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX2P48431 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX2P48431 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX2P48431 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX2P48431 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX2P48431 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX2P48431 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX2P48431 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX2P48431 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX2P48431 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX2P48431 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX2P48431 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SOX2P48431 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX2P48431 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX2P48431 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX2P48431 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX2P48431 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX2P48431 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms