Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTRLP40313 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTRLP40313 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTRLP40313 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTRLP40313 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTRLP40313 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTRLP40313 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTRLP40313 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTRLP40313 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTRLP40313 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTRLP40313 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTRLP40313 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTRLP40313 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTRLP40313 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTRLP40313 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTRLP40313 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTRLP40313 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTRLP40313 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTRLP40313 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTRLP40313 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTRLP40313 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTRLP40313 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTRLP40313 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTRLP40313 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTRLP40313 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTRLP40313 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTRLP40313 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTRLP40313 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CTRLP40313 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CTRLP40313 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTRLP40313 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTRLP40313 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTRLP40313 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTRLP40313 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTRLP40313 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTRLP40313 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTRLP40313 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTRLP40313 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTRLP40313 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTRLP40313 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTRLP40313 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTRLP40313 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTRLP40313 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTRLP40313 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTRLP40313 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTRLP40313 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTRLP40313 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTRLP40313 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTRLP40313 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTRLP40313 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTRLP40313 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTRLP40313 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTRLP40313 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTRLP40313 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTRLP40313 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTRLP40313 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTRLP40313 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTRLP40313 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTRLP40313 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTRLP40313 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTRLP40313 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTRLP40313 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTRLP40313 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTRLP40313 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTRLP40313 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTRLP40313 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTRLP40313 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTRLP40313 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTRLP40313 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTRLP40313 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTRLP40313 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTRLP40313 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTRLP40313 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTRLP40313 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTRLP40313 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTRLP40313 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTRLP40313 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTRLP40313 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTRLP40313 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTRLP40313 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTRLP40313 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTRLP40313 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTRLP40313 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTRLP40313 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTRLP40313 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTRLP40313 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTRLP40313 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTRLP40313 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTRLP40313 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTRLP40313 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTRLP40313 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTRLP40313 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTRLP40313 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTRLP40313 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTRLP40313 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTRLP40313 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTRLP40313 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTRLP40313 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTRLP40313 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTRLP40313 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms