Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
DDIT3P35638 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
DDIT3P35638 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
DDIT3P35638 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
DDIT3P35638 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
DDIT3P35638 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
DDIT3P35638 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
DDIT3P35638 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
DDIT3P35638 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
DDIT3P35638 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
DDIT3P35638 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
DDIT3P35638 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
DDIT3P35638 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
DDIT3P35638 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
DDIT3P35638 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
DDIT3P35638 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
DDIT3P35638 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
DDIT3P35638 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
DDIT3P35638 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
DDIT3P35638 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
DDIT3P35638 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
DDIT3P35638 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
DDIT3P35638 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
DDIT3P35638 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
DDIT3P35638 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
DDIT3P35638 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
DDIT3P35638 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
DDIT3P35638 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
DDIT3P35638 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
DDIT3P35638 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
DDIT3P35638 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
DDIT3P35638 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
DDIT3P35638 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
DDIT3P35638 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
DDIT3P35638 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
DDIT3P35638 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
DDIT3P35638 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
DDIT3P35638 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
DDIT3P35638 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
DDIT3P35638 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
DDIT3P35638 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
DDIT3P35638 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
DDIT3P35638 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
DDIT3P35638 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
DDIT3P35638 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
DDIT3P35638 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
DDIT3P35638 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
DDIT3P35638 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
DDIT3P35638 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
DDIT3P35638 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
DDIT3P35638 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
DDIT3P35638 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
DDIT3P35638 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
DDIT3P35638 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
DDIT3P35638 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
DDIT3P35638 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
DDIT3P35638 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
DDIT3P35638 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
DDIT3P35638 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
DDIT3P35638 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
DDIT3P35638 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
DDIT3P35638 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
DDIT3P35638 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
DDIT3P35638 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
DDIT3P35638 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
DDIT3P35638 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
DDIT3P35638 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
DDIT3P35638 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
DDIT3P35638 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
DDIT3P35638 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
DDIT3P35638 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
DDIT3P35638 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
DDIT3P35638 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
DDIT3P35638 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
DDIT3P35638 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
DDIT3P35638 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
DDIT3P35638 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
DDIT3P35638 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
DDIT3P35638 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
DDIT3P35638 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
DDIT3P35638 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
DDIT3P35638 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
DDIT3P35638 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
DDIT3P35638 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
DDIT3P35638 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
DDIT3P35638 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
DDIT3P35638 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.92
DDIT3P35638 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
DDIT3P35638 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
DDIT3P35638 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
DDIT3P35638 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
DDIT3P35638 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
DDIT3P35638 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
DDIT3P35638 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
DDIT3P35638 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
DDIT3P35638 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
DDIT3P35638 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
DDIT3P35638 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
DDIT3P35638 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
DDIT3P35638 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms