Protein–RNA interactions for Protein: P35523

CLCN1, Chloride channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN1P35523 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CLCN1P35523 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
CLCN1P35523 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CLCN1P35523 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CLCN1P35523 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CLCN1P35523 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CLCN1P35523 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CLCN1P35523 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CLCN1P35523 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CLCN1P35523 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CLCN1P35523 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CLCN1P35523 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CLCN1P35523 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CLCN1P35523 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CLCN1P35523 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CLCN1P35523 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CLCN1P35523 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CLCN1P35523 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CLCN1P35523 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CLCN1P35523 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CLCN1P35523 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CLCN1P35523 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CLCN1P35523 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CLCN1P35523 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CLCN1P35523 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CLCN1P35523 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CLCN1P35523 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CLCN1P35523 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CLCN1P35523 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CLCN1P35523 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CLCN1P35523 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CLCN1P35523 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CLCN1P35523 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CLCN1P35523 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLCN1P35523 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CLCN1P35523 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CLCN1P35523 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CLCN1P35523 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CLCN1P35523 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CLCN1P35523 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CLCN1P35523 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CLCN1P35523 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CLCN1P35523 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CLCN1P35523 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CLCN1P35523 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CLCN1P35523 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CLCN1P35523 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CLCN1P35523 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLCN1P35523 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLCN1P35523 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLCN1P35523 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLCN1P35523 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CLCN1P35523 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLCN1P35523 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CLCN1P35523 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CLCN1P35523 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLCN1P35523 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLCN1P35523 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLCN1P35523 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CLCN1P35523 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CLCN1P35523 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CLCN1P35523 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CLCN1P35523 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CLCN1P35523 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CLCN1P35523 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CLCN1P35523 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CLCN1P35523 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CLCN1P35523 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CLCN1P35523 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CLCN1P35523 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CLCN1P35523 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CLCN1P35523 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
CLCN1P35523 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
CLCN1P35523 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CLCN1P35523 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CLCN1P35523 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CLCN1P35523 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CLCN1P35523 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CLCN1P35523 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CLCN1P35523 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CLCN1P35523 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CLCN1P35523 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CLCN1P35523 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CLCN1P35523 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CLCN1P35523 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CLCN1P35523 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CLCN1P35523 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CLCN1P35523 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CLCN1P35523 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CLCN1P35523 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CLCN1P35523 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CLCN1P35523 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CLCN1P35523 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
CLCN1P35523 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CLCN1P35523 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CLCN1P35523 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CLCN1P35523 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CLCN1P35523 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CLCN1P35523 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
CLCN1P35523 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms