Protein–RNA interactions for Protein: P35523

CLCN1, Chloride channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN1P35523 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC39.21■■■■□ 3.87
CLCN1P35523 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CLCN1P35523 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CLCN1P35523 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CLCN1P35523 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CLCN1P35523 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CLCN1P35523 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CLCN1P35523 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CLCN1P35523 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CLCN1P35523 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CLCN1P35523 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CLCN1P35523 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CLCN1P35523 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CLCN1P35523 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CLCN1P35523 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CLCN1P35523 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CLCN1P35523 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
CLCN1P35523 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CLCN1P35523 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CLCN1P35523 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CLCN1P35523 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CLCN1P35523 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CLCN1P35523 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLCN1P35523 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CLCN1P35523 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CLCN1P35523 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CLCN1P35523 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CLCN1P35523 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CLCN1P35523 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CLCN1P35523 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CLCN1P35523 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CLCN1P35523 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CLCN1P35523 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CLCN1P35523 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CLCN1P35523 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CLCN1P35523 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CLCN1P35523 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CLCN1P35523 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CLCN1P35523 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CLCN1P35523 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CLCN1P35523 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CLCN1P35523 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CLCN1P35523 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CLCN1P35523 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CLCN1P35523 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CLCN1P35523 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CLCN1P35523 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CLCN1P35523 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CLCN1P35523 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CLCN1P35523 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLCN1P35523 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLCN1P35523 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLCN1P35523 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLCN1P35523 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLCN1P35523 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CLCN1P35523 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLCN1P35523 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CLCN1P35523 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CLCN1P35523 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CLCN1P35523 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CLCN1P35523 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLCN1P35523 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CLCN1P35523 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CLCN1P35523 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CLCN1P35523 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CLCN1P35523 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CLCN1P35523 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CLCN1P35523 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLCN1P35523 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CLCN1P35523 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLCN1P35523 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLCN1P35523 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CLCN1P35523 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CLCN1P35523 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLCN1P35523 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CLCN1P35523 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CLCN1P35523 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLCN1P35523 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CLCN1P35523 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CLCN1P35523 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLCN1P35523 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLCN1P35523 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLCN1P35523 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CLCN1P35523 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CLCN1P35523 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CLCN1P35523 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CLCN1P35523 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CLCN1P35523 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLCN1P35523 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLCN1P35523 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLCN1P35523 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
CLCN1P35523 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CLCN1P35523 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CLCN1P35523 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CLCN1P35523 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CLCN1P35523 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CLCN1P35523 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CLCN1P35523 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CLCN1P35523 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CLCN1P35523 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms