Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HTR1EP28566 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HTR1EP28566 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HTR1EP28566 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HTR1EP28566 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HTR1EP28566 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HTR1EP28566 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HTR1EP28566 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HTR1EP28566 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HTR1EP28566 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HTR1EP28566 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HTR1EP28566 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HTR1EP28566 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HTR1EP28566 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HTR1EP28566 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HTR1EP28566 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HTR1EP28566 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HTR1EP28566 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HTR1EP28566 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HTR1EP28566 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HTR1EP28566 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HTR1EP28566 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HTR1EP28566 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HTR1EP28566 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HTR1EP28566 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HTR1EP28566 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HTR1EP28566 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HTR1EP28566 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HTR1EP28566 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HTR1EP28566 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HTR1EP28566 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HTR1EP28566 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HTR1EP28566 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HTR1EP28566 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HTR1EP28566 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HTR1EP28566 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HTR1EP28566 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HTR1EP28566 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HTR1EP28566 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HTR1EP28566 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HTR1EP28566 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HTR1EP28566 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HTR1EP28566 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HTR1EP28566 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HTR1EP28566 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HTR1EP28566 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HTR1EP28566 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HTR1EP28566 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HTR1EP28566 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HTR1EP28566 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HTR1EP28566 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HTR1EP28566 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HTR1EP28566 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HTR1EP28566 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HTR1EP28566 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HTR1EP28566 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HTR1EP28566 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HTR1EP28566 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HTR1EP28566 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HTR1EP28566 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HTR1EP28566 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HTR1EP28566 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HTR1EP28566 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HTR1EP28566 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HTR1EP28566 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HTR1EP28566 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HTR1EP28566 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HTR1EP28566 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HTR1EP28566 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HTR1EP28566 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HTR1EP28566 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HTR1EP28566 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HTR1EP28566 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HTR1EP28566 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HTR1EP28566 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HTR1EP28566 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HTR1EP28566 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HTR1EP28566 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HTR1EP28566 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HTR1EP28566 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HTR1EP28566 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HTR1EP28566 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HTR1EP28566 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTR1EP28566 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTR1EP28566 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTR1EP28566 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HTR1EP28566 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HTR1EP28566 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HTR1EP28566 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HTR1EP28566 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HTR1EP28566 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HTR1EP28566 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HTR1EP28566 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTR1EP28566 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HTR1EP28566 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HTR1EP28566 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HTR1EP28566 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HTR1EP28566 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HTR1EP28566 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HTR1EP28566 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms