Protein–RNA interactions for Protein: P27695

APEX1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX1P27695 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APEX1P27695 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APEX1P27695 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APEX1P27695 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APEX1P27695 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APEX1P27695 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APEX1P27695 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APEX1P27695 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APEX1P27695 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APEX1P27695 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APEX1P27695 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APEX1P27695 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APEX1P27695 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APEX1P27695 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APEX1P27695 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APEX1P27695 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APEX1P27695 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APEX1P27695 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APEX1P27695 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APEX1P27695 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APEX1P27695 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APEX1P27695 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APEX1P27695 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APEX1P27695 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APEX1P27695 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APEX1P27695 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APEX1P27695 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
APEX1P27695 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APEX1P27695 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APEX1P27695 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
APEX1P27695 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APEX1P27695 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APEX1P27695 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APEX1P27695 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APEX1P27695 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APEX1P27695 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APEX1P27695 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APEX1P27695 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APEX1P27695 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APEX1P27695 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APEX1P27695 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APEX1P27695 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APEX1P27695 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APEX1P27695 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APEX1P27695 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APEX1P27695 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APEX1P27695 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APEX1P27695 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APEX1P27695 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APEX1P27695 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
APEX1P27695 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APEX1P27695 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APEX1P27695 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APEX1P27695 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APEX1P27695 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APEX1P27695 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APEX1P27695 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APEX1P27695 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APEX1P27695 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APEX1P27695 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APEX1P27695 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APEX1P27695 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
APEX1P27695 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
APEX1P27695 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APEX1P27695 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APEX1P27695 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APEX1P27695 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APEX1P27695 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APEX1P27695 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APEX1P27695 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APEX1P27695 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APEX1P27695 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APEX1P27695 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APEX1P27695 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APEX1P27695 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APEX1P27695 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APEX1P27695 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APEX1P27695 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APEX1P27695 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APEX1P27695 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APEX1P27695 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APEX1P27695 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APEX1P27695 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APEX1P27695 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APEX1P27695 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APEX1P27695 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APEX1P27695 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APEX1P27695 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APEX1P27695 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
APEX1P27695 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APEX1P27695 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APEX1P27695 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APEX1P27695 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APEX1P27695 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APEX1P27695 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APEX1P27695 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APEX1P27695 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APEX1P27695 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APEX1P27695 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APEX1P27695 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms