Protein–RNA interactions for Protein: P20226

TBP, TATA-box-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBPP20226 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TBPP20226 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TBPP20226 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TBPP20226 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TBPP20226 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TBPP20226 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TBPP20226 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TBPP20226 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TBPP20226 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TBPP20226 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TBPP20226 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBPP20226 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TBPP20226 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TBPP20226 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TBPP20226 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TBPP20226 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TBPP20226 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBPP20226 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TBPP20226 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TBPP20226 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TBPP20226 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TBPP20226 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TBPP20226 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TBPP20226 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TBPP20226 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TBPP20226 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TBPP20226 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBPP20226 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBPP20226 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TBPP20226 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TBPP20226 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TBPP20226 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TBPP20226 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBPP20226 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBPP20226 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBPP20226 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBPP20226 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBPP20226 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBPP20226 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBPP20226 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBPP20226 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBPP20226 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBPP20226 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBPP20226 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBPP20226 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TBPP20226 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TBPP20226 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TBPP20226 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBPP20226 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TBPP20226 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TBPP20226 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBPP20226 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBPP20226 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TBPP20226 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TBPP20226 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TBPP20226 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TBPP20226 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TBPP20226 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TBPP20226 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TBPP20226 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TBPP20226 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TBPP20226 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TBPP20226 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TBPP20226 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TBPP20226 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TBPP20226 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TBPP20226 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TBPP20226 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TBPP20226 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TBPP20226 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TBPP20226 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TBPP20226 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TBPP20226 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TBPP20226 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TBPP20226 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TBPP20226 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TBPP20226 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBPP20226 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBPP20226 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBPP20226 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBPP20226 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBPP20226 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBPP20226 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBPP20226 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TBPP20226 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBPP20226 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBPP20226 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBPP20226 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBPP20226 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBPP20226 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBPP20226 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TBPP20226 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TBPP20226 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TBPP20226 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TBPP20226 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TBPP20226 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TBPP20226 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TBPP20226 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TBPP20226 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TBPP20226 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms