Protein–RNA interactions for Protein: P08949

NMB, Neuromedin-B, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBP08949 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NMBP08949 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NMBP08949 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NMBP08949 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NMBP08949 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NMBP08949 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NMBP08949 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NMBP08949 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NMBP08949 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NMBP08949 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NMBP08949 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NMBP08949 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NMBP08949 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NMBP08949 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NMBP08949 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NMBP08949 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NMBP08949 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NMBP08949 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NMBP08949 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NMBP08949 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NMBP08949 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NMBP08949 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NMBP08949 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NMBP08949 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NMBP08949 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NMBP08949 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NMBP08949 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NMBP08949 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NMBP08949 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NMBP08949 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NMBP08949 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NMBP08949 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NMBP08949 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NMBP08949 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NMBP08949 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NMBP08949 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NMBP08949 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NMBP08949 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NMBP08949 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NMBP08949 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NMBP08949 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NMBP08949 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NMBP08949 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NMBP08949 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NMBP08949 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NMBP08949 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NMBP08949 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NMBP08949 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NMBP08949 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NMBP08949 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NMBP08949 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NMBP08949 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NMBP08949 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NMBP08949 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NMBP08949 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NMBP08949 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NMBP08949 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NMBP08949 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NMBP08949 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NMBP08949 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NMBP08949 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NMBP08949 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NMBP08949 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NMBP08949 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NMBP08949 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NMBP08949 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NMBP08949 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NMBP08949 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NMBP08949 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NMBP08949 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NMBP08949 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NMBP08949 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NMBP08949 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NMBP08949 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NMBP08949 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NMBP08949 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NMBP08949 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NMBP08949 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NMBP08949 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NMBP08949 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NMBP08949 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NMBP08949 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NMBP08949 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NMBP08949 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NMBP08949 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NMBP08949 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NMBP08949 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NMBP08949 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NMBP08949 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NMBP08949 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NMBP08949 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NMBP08949 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NMBP08949 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NMBP08949 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NMBP08949 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NMBP08949 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NMBP08949 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NMBP08949 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NMBP08949 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NMBP08949 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms