Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPSAP08865 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPSAP08865 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPSAP08865 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPSAP08865 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPSAP08865 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPSAP08865 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPSAP08865 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPSAP08865 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPSAP08865 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPSAP08865 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPSAP08865 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPSAP08865 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPSAP08865 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPSAP08865 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPSAP08865 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RPSAP08865 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPSAP08865 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPSAP08865 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPSAP08865 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPSAP08865 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPSAP08865 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPSAP08865 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPSAP08865 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPSAP08865 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPSAP08865 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPSAP08865 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RPSAP08865 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPSAP08865 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPSAP08865 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPSAP08865 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPSAP08865 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RPSAP08865 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RPSAP08865 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RPSAP08865 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPSAP08865 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RPSAP08865 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPSAP08865 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPSAP08865 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPSAP08865 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPSAP08865 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPSAP08865 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPSAP08865 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPSAP08865 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPSAP08865 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPSAP08865 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RPSAP08865 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPSAP08865 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPSAP08865 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPSAP08865 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPSAP08865 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPSAP08865 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPSAP08865 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPSAP08865 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPSAP08865 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPSAP08865 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPSAP08865 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPSAP08865 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPSAP08865 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPSAP08865 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPSAP08865 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPSAP08865 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPSAP08865 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPSAP08865 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPSAP08865 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPSAP08865 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPSAP08865 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPSAP08865 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPSAP08865 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPSAP08865 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPSAP08865 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPSAP08865 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPSAP08865 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPSAP08865 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPSAP08865 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RPSAP08865 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPSAP08865 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RPSAP08865 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPSAP08865 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPSAP08865 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPSAP08865 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPSAP08865 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RPSAP08865 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPSAP08865 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPSAP08865 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPSAP08865 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPSAP08865 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RPSAP08865 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPSAP08865 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPSAP08865 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPSAP08865 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPSAP08865 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPSAP08865 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPSAP08865 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPSAP08865 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPSAP08865 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPSAP08865 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPSAP08865 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPSAP08865 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPSAP08865 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms