Protein–RNA interactions for Protein: P04637

TP53, Cellular tumor antigen p53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53P04637 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TP53P04637 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TP53P04637 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TP53P04637 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TP53P04637 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TP53P04637 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TP53P04637 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TP53P04637 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TP53P04637 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TP53P04637 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TP53P04637 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TP53P04637 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TP53P04637 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TP53P04637 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TP53P04637 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TP53P04637 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TP53P04637 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TP53P04637 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TP53P04637 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TP53P04637 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TP53P04637 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TP53P04637 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TP53P04637 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TP53P04637 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TP53P04637 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TP53P04637 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TP53P04637 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TP53P04637 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TP53P04637 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TP53P04637 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TP53P04637 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TP53P04637 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TP53P04637 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TP53P04637 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TP53P04637 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TP53P04637 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TP53P04637 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TP53P04637 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TP53P04637 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TP53P04637 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TP53P04637 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TP53P04637 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TP53P04637 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TP53P04637 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TP53P04637 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TP53P04637 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TP53P04637 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TP53P04637 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TP53P04637 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TP53P04637 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TP53P04637 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TP53P04637 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TP53P04637 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TP53P04637 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TP53P04637 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TP53P04637 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TP53P04637 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TP53P04637 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TP53P04637 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TP53P04637 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TP53P04637 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TP53P04637 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TP53P04637 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TP53P04637 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TP53P04637 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TP53P04637 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TP53P04637 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TP53P04637 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TP53P04637 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TP53P04637 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TP53P04637 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TP53P04637 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TP53P04637 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TP53P04637 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TP53P04637 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TP53P04637 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TP53P04637 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TP53P04637 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TP53P04637 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TP53P04637 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TP53P04637 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TP53P04637 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TP53P04637 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TP53P04637 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TP53P04637 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TP53P04637 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TP53P04637 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TP53P04637 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TP53P04637 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TP53P04637 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TP53P04637 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TP53P04637 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TP53P04637 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TP53P04637 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TP53P04637 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TP53P04637 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TP53P04637 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TP53P04637 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TP53P04637 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TP53P04637 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms