Protein–RNA interactions for Protein: P03886

MT-ND1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND1P03886 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MT-ND1P03886 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MT-ND1P03886 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MT-ND1P03886 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MT-ND1P03886 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MT-ND1P03886 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MT-ND1P03886 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MT-ND1P03886 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MT-ND1P03886 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MT-ND1P03886 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MT-ND1P03886 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MT-ND1P03886 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MT-ND1P03886 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MT-ND1P03886 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MT-ND1P03886 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MT-ND1P03886 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MT-ND1P03886 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MT-ND1P03886 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MT-ND1P03886 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MT-ND1P03886 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MT-ND1P03886 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MT-ND1P03886 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MT-ND1P03886 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MT-ND1P03886 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MT-ND1P03886 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MT-ND1P03886 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MT-ND1P03886 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MT-ND1P03886 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MT-ND1P03886 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MT-ND1P03886 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MT-ND1P03886 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MT-ND1P03886 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MT-ND1P03886 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MT-ND1P03886 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MT-ND1P03886 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MT-ND1P03886 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MT-ND1P03886 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MT-ND1P03886 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MT-ND1P03886 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MT-ND1P03886 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MT-ND1P03886 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MT-ND1P03886 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MT-ND1P03886 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MT-ND1P03886 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MT-ND1P03886 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MT-ND1P03886 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MT-ND1P03886 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MT-ND1P03886 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MT-ND1P03886 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MT-ND1P03886 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MT-ND1P03886 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MT-ND1P03886 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MT-ND1P03886 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MT-ND1P03886 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MT-ND1P03886 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MT-ND1P03886 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MT-ND1P03886 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MT-ND1P03886 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MT-ND1P03886 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MT-ND1P03886 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MT-ND1P03886 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MT-ND1P03886 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MT-ND1P03886 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MT-ND1P03886 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MT-ND1P03886 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MT-ND1P03886 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MT-ND1P03886 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MT-ND1P03886 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MT-ND1P03886 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MT-ND1P03886 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MT-ND1P03886 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MT-ND1P03886 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MT-ND1P03886 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MT-ND1P03886 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MT-ND1P03886 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MT-ND1P03886 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MT-ND1P03886 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MT-ND1P03886 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MT-ND1P03886 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MT-ND1P03886 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MT-ND1P03886 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MT-ND1P03886 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MT-ND1P03886 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MT-ND1P03886 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MT-ND1P03886 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MT-ND1P03886 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MT-ND1P03886 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MT-ND1P03886 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MT-ND1P03886 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MT-ND1P03886 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MT-ND1P03886 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MT-ND1P03886 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MT-ND1P03886 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MT-ND1P03886 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MT-ND1P03886 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MT-ND1P03886 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MT-ND1P03886 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MT-ND1P03886 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MT-ND1P03886 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MT-ND1P03886 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms