Protein–RNA interactions for Protein: O95455

TGDS, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGDSO95455 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TGDSO95455 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TGDSO95455 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TGDSO95455 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TGDSO95455 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TGDSO95455 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TGDSO95455 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TGDSO95455 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TGDSO95455 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TGDSO95455 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TGDSO95455 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TGDSO95455 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TGDSO95455 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TGDSO95455 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TGDSO95455 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TGDSO95455 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TGDSO95455 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TGDSO95455 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TGDSO95455 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TGDSO95455 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TGDSO95455 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TGDSO95455 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TGDSO95455 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TGDSO95455 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TGDSO95455 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TGDSO95455 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TGDSO95455 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TGDSO95455 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TGDSO95455 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TGDSO95455 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TGDSO95455 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TGDSO95455 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TGDSO95455 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TGDSO95455 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TGDSO95455 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TGDSO95455 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TGDSO95455 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TGDSO95455 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TGDSO95455 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TGDSO95455 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TGDSO95455 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TGDSO95455 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TGDSO95455 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TGDSO95455 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TGDSO95455 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TGDSO95455 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TGDSO95455 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TGDSO95455 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TGDSO95455 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TGDSO95455 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TGDSO95455 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TGDSO95455 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TGDSO95455 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TGDSO95455 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TGDSO95455 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TGDSO95455 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TGDSO95455 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TGDSO95455 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TGDSO95455 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TGDSO95455 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TGDSO95455 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TGDSO95455 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TGDSO95455 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TGDSO95455 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TGDSO95455 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TGDSO95455 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TGDSO95455 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TGDSO95455 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TGDSO95455 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TGDSO95455 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TGDSO95455 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TGDSO95455 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TGDSO95455 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TGDSO95455 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TGDSO95455 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TGDSO95455 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TGDSO95455 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TGDSO95455 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TGDSO95455 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TGDSO95455 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TGDSO95455 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TGDSO95455 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TGDSO95455 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TGDSO95455 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TGDSO95455 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TGDSO95455 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TGDSO95455 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TGDSO95455 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TGDSO95455 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TGDSO95455 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TGDSO95455 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TGDSO95455 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TGDSO95455 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TGDSO95455 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TGDSO95455 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TGDSO95455 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TGDSO95455 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TGDSO95455 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TGDSO95455 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TGDSO95455 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms