Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYS1-DBNDD2H3BUS1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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