Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SRRM3A6NNA2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SRRM3A6NNA2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SRRM3A6NNA2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SRRM3A6NNA2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
SRRM3A6NNA2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SRRM3A6NNA2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SRRM3A6NNA2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SRRM3A6NNA2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SRRM3A6NNA2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SRRM3A6NNA2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SRRM3A6NNA2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SRRM3A6NNA2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SRRM3A6NNA2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SRRM3A6NNA2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SRRM3A6NNA2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SRRM3A6NNA2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SRRM3A6NNA2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SRRM3A6NNA2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SRRM3A6NNA2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SRRM3A6NNA2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SRRM3A6NNA2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SRRM3A6NNA2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SRRM3A6NNA2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SRRM3A6NNA2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRRM3A6NNA2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRRM3A6NNA2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SRRM3A6NNA2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SRRM3A6NNA2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SRRM3A6NNA2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SRRM3A6NNA2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SRRM3A6NNA2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SRRM3A6NNA2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SRRM3A6NNA2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SRRM3A6NNA2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SRRM3A6NNA2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SRRM3A6NNA2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SRRM3A6NNA2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SRRM3A6NNA2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SRRM3A6NNA2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SRRM3A6NNA2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SRRM3A6NNA2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SRRM3A6NNA2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRRM3A6NNA2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRRM3A6NNA2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SRRM3A6NNA2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SRRM3A6NNA2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SRRM3A6NNA2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SRRM3A6NNA2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SRRM3A6NNA2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRRM3A6NNA2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRRM3A6NNA2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRRM3A6NNA2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRRM3A6NNA2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SRRM3A6NNA2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SRRM3A6NNA2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SRRM3A6NNA2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SRRM3A6NNA2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SRRM3A6NNA2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SRRM3A6NNA2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRRM3A6NNA2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRRM3A6NNA2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRRM3A6NNA2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRRM3A6NNA2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRRM3A6NNA2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SRRM3A6NNA2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SRRM3A6NNA2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SRRM3A6NNA2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SRRM3A6NNA2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRRM3A6NNA2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SRRM3A6NNA2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SRRM3A6NNA2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SRRM3A6NNA2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SRRM3A6NNA2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SRRM3A6NNA2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRRM3A6NNA2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRRM3A6NNA2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SRRM3A6NNA2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SRRM3A6NNA2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SRRM3A6NNA2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SRRM3A6NNA2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SRRM3A6NNA2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SRRM3A6NNA2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SRRM3A6NNA2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SRRM3A6NNA2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRRM3A6NNA2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SRRM3A6NNA2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SRRM3A6NNA2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SRRM3A6NNA2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRRM3A6NNA2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRRM3A6NNA2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SRRM3A6NNA2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRRM3A6NNA2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRRM3A6NNA2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRRM3A6NNA2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRRM3A6NNA2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRRM3A6NNA2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRRM3A6NNA2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRRM3A6NNA2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRRM3A6NNA2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms