Protein–RNA interactions for Protein: A6NHY6

C9orf118, Putative uncharacterized protein C9orf118, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf118A6NHY6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf118A6NHY6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf118A6NHY6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf118A6NHY6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf118A6NHY6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf118A6NHY6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf118A6NHY6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf118A6NHY6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf118A6NHY6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf118A6NHY6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf118A6NHY6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf118A6NHY6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf118A6NHY6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf118A6NHY6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf118A6NHY6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf118A6NHY6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf118A6NHY6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf118A6NHY6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf118A6NHY6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf118A6NHY6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf118A6NHY6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf118A6NHY6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf118A6NHY6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf118A6NHY6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf118A6NHY6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf118A6NHY6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf118A6NHY6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf118A6NHY6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf118A6NHY6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf118A6NHY6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf118A6NHY6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf118A6NHY6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf118A6NHY6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf118A6NHY6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf118A6NHY6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf118A6NHY6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf118A6NHY6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf118A6NHY6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf118A6NHY6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf118A6NHY6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf118A6NHY6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf118A6NHY6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf118A6NHY6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C9orf118A6NHY6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C9orf118A6NHY6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf118A6NHY6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf118A6NHY6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf118A6NHY6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf118A6NHY6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C9orf118A6NHY6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C9orf118A6NHY6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C9orf118A6NHY6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C9orf118A6NHY6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C9orf118A6NHY6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C9orf118A6NHY6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C9orf118A6NHY6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C9orf118A6NHY6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C9orf118A6NHY6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C9orf118A6NHY6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
C9orf118A6NHY6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C9orf118A6NHY6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
C9orf118A6NHY6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C9orf118A6NHY6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
C9orf118A6NHY6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C9orf118A6NHY6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf118A6NHY6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf118A6NHY6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf118A6NHY6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf118A6NHY6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf118A6NHY6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C9orf118A6NHY6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C9orf118A6NHY6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf118A6NHY6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf118A6NHY6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf118A6NHY6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C9orf118A6NHY6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C9orf118A6NHY6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
C9orf118A6NHY6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
C9orf118A6NHY6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C9orf118A6NHY6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C9orf118A6NHY6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C9orf118A6NHY6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
C9orf118A6NHY6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
C9orf118A6NHY6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
C9orf118A6NHY6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C9orf118A6NHY6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C9orf118A6NHY6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
C9orf118A6NHY6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C9orf118A6NHY6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C9orf118A6NHY6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf118A6NHY6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf118A6NHY6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf118A6NHY6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf118A6NHY6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
C9orf118A6NHY6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf118A6NHY6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf118A6NHY6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf118A6NHY6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf118A6NHY6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf118A6NHY6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms