Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00862A6NCI5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00862A6NCI5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00862A6NCI5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00862A6NCI5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00862A6NCI5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00862A6NCI5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00862A6NCI5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00862A6NCI5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00862A6NCI5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINC00862A6NCI5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINC00862A6NCI5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00862A6NCI5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00862A6NCI5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00862A6NCI5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00862A6NCI5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00862A6NCI5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00862A6NCI5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00862A6NCI5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00862A6NCI5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00862A6NCI5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00862A6NCI5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00862A6NCI5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00862A6NCI5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00862A6NCI5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00862A6NCI5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00862A6NCI5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00862A6NCI5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00862A6NCI5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00862A6NCI5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00862A6NCI5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00862A6NCI5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00862A6NCI5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00862A6NCI5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC00862A6NCI5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC00862A6NCI5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00862A6NCI5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00862A6NCI5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00862A6NCI5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00862A6NCI5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00862A6NCI5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00862A6NCI5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00862A6NCI5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00862A6NCI5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00862A6NCI5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00862A6NCI5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00862A6NCI5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00862A6NCI5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00862A6NCI5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00862A6NCI5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00862A6NCI5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00862A6NCI5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00862A6NCI5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00862A6NCI5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00862A6NCI5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00862A6NCI5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00862A6NCI5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00862A6NCI5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00862A6NCI5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00862A6NCI5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00862A6NCI5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00862A6NCI5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00862A6NCI5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00862A6NCI5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00862A6NCI5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00862A6NCI5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00862A6NCI5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00862A6NCI5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00862A6NCI5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00862A6NCI5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00862A6NCI5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00862A6NCI5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00862A6NCI5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00862A6NCI5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00862A6NCI5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00862A6NCI5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LINC00862A6NCI5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00862A6NCI5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00862A6NCI5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00862A6NCI5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00862A6NCI5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00862A6NCI5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00862A6NCI5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00862A6NCI5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00862A6NCI5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
LINC00862A6NCI5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00862A6NCI5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00862A6NCI5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00862A6NCI5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00862A6NCI5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00862A6NCI5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00862A6NCI5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00862A6NCI5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00862A6NCI5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00862A6NCI5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00862A6NCI5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00862A6NCI5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00862A6NCI5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00862A6NCI5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00862A6NCI5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms