Protein–RNA interactions for Protein: A0A589

TCRBV7S2A1N4T, V_segment translation product (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV7S2A1N4TA0A589 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TCRBV7S2A1N4TA0A589 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
TCRBV7S2A1N4TA0A589 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TCRBV7S2A1N4TA0A589 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TCRBV7S2A1N4TA0A589 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TCRBV7S2A1N4TA0A589 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TCRBV7S2A1N4TA0A589 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TCRBV7S2A1N4TA0A589 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TCRBV7S2A1N4TA0A589 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TCRBV7S2A1N4TA0A589 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TCRBV7S2A1N4TA0A589 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TCRBV7S2A1N4TA0A589 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TCRBV7S2A1N4TA0A589 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TCRBV7S2A1N4TA0A589 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TCRBV7S2A1N4TA0A589 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TCRBV7S2A1N4TA0A589 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TCRBV7S2A1N4TA0A589 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TCRBV7S2A1N4TA0A589 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TCRBV7S2A1N4TA0A589 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TCRBV7S2A1N4TA0A589 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TCRBV7S2A1N4TA0A589 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TCRBV7S2A1N4TA0A589 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TCRBV7S2A1N4TA0A589 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TCRBV7S2A1N4TA0A589 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TCRBV7S2A1N4TA0A589 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TCRBV7S2A1N4TA0A589 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TCRBV7S2A1N4TA0A589 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TCRBV7S2A1N4TA0A589 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TCRBV7S2A1N4TA0A589 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TCRBV7S2A1N4TA0A589 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TCRBV7S2A1N4TA0A589 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TCRBV7S2A1N4TA0A589 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TCRBV7S2A1N4TA0A589 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TCRBV7S2A1N4TA0A589 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TCRBV7S2A1N4TA0A589 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TCRBV7S2A1N4TA0A589 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TCRBV7S2A1N4TA0A589 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCRBV7S2A1N4TA0A589 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCRBV7S2A1N4TA0A589 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TCRBV7S2A1N4TA0A589 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TCRBV7S2A1N4TA0A589 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TCRBV7S2A1N4TA0A589 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TCRBV7S2A1N4TA0A589 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TCRBV7S2A1N4TA0A589 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TCRBV7S2A1N4TA0A589 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TCRBV7S2A1N4TA0A589 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TCRBV7S2A1N4TA0A589 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TCRBV7S2A1N4TA0A589 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TCRBV7S2A1N4TA0A589 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TCRBV7S2A1N4TA0A589 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TCRBV7S2A1N4TA0A589 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TCRBV7S2A1N4TA0A589 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TCRBV7S2A1N4TA0A589 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TCRBV7S2A1N4TA0A589 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TCRBV7S2A1N4TA0A589 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TCRBV7S2A1N4TA0A589 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TCRBV7S2A1N4TA0A589 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TCRBV7S2A1N4TA0A589 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TCRBV7S2A1N4TA0A589 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TCRBV7S2A1N4TA0A589 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TCRBV7S2A1N4TA0A589 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TCRBV7S2A1N4TA0A589 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TCRBV7S2A1N4TA0A589 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TCRBV7S2A1N4TA0A589 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TCRBV7S2A1N4TA0A589 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TCRBV7S2A1N4TA0A589 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TCRBV7S2A1N4TA0A589 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TCRBV7S2A1N4TA0A589 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TCRBV7S2A1N4TA0A589 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TCRBV7S2A1N4TA0A589 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TCRBV7S2A1N4TA0A589 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TCRBV7S2A1N4TA0A589 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TCRBV7S2A1N4TA0A589 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TCRBV7S2A1N4TA0A589 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TCRBV7S2A1N4TA0A589 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TCRBV7S2A1N4TA0A589 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TCRBV7S2A1N4TA0A589 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TCRBV7S2A1N4TA0A589 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TCRBV7S2A1N4TA0A589 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TCRBV7S2A1N4TA0A589 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TCRBV7S2A1N4TA0A589 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TCRBV7S2A1N4TA0A589 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TCRBV7S2A1N4TA0A589 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TCRBV7S2A1N4TA0A589 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TCRBV7S2A1N4TA0A589 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TCRBV7S2A1N4TA0A589 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TCRBV7S2A1N4TA0A589 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TCRBV7S2A1N4TA0A589 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms