Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT02

TRAV9-2, T-cell receptor alpha variable 9-2 (Fragment), humanhuman

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV9-2A0A087WT02 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAV9-2A0A087WT02 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAV9-2A0A087WT02 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAV9-2A0A087WT02 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAV9-2A0A087WT02 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAV9-2A0A087WT02 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAV9-2A0A087WT02 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAV9-2A0A087WT02 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAV9-2A0A087WT02 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAV9-2A0A087WT02 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAV9-2A0A087WT02 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAV9-2A0A087WT02 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAV9-2A0A087WT02 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAV9-2A0A087WT02 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAV9-2A0A087WT02 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAV9-2A0A087WT02 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAV9-2A0A087WT02 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAV9-2A0A087WT02 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAV9-2A0A087WT02 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAV9-2A0A087WT02 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAV9-2A0A087WT02 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAV9-2A0A087WT02 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAV9-2A0A087WT02 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAV9-2A0A087WT02 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAV9-2A0A087WT02 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAV9-2A0A087WT02 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAV9-2A0A087WT02 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAV9-2A0A087WT02 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAV9-2A0A087WT02 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAV9-2A0A087WT02 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAV9-2A0A087WT02 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAV9-2A0A087WT02 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAV9-2A0A087WT02 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAV9-2A0A087WT02 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAV9-2A0A087WT02 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAV9-2A0A087WT02 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAV9-2A0A087WT02 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAV9-2A0A087WT02 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAV9-2A0A087WT02 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAV9-2A0A087WT02 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAV9-2A0A087WT02 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAV9-2A0A087WT02 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAV9-2A0A087WT02 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAV9-2A0A087WT02 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAV9-2A0A087WT02 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAV9-2A0A087WT02 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAV9-2A0A087WT02 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAV9-2A0A087WT02 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAV9-2A0A087WT02 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAV9-2A0A087WT02 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAV9-2A0A087WT02 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAV9-2A0A087WT02 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAV9-2A0A087WT02 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAV9-2A0A087WT02 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAV9-2A0A087WT02 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAV9-2A0A087WT02 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAV9-2A0A087WT02 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAV9-2A0A087WT02 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAV9-2A0A087WT02 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAV9-2A0A087WT02 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAV9-2A0A087WT02 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAV9-2A0A087WT02 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAV9-2A0A087WT02 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAV9-2A0A087WT02 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAV9-2A0A087WT02 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAV9-2A0A087WT02 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAV9-2A0A087WT02 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAV9-2A0A087WT02 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAV9-2A0A087WT02 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAV9-2A0A087WT02 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAV9-2A0A087WT02 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAV9-2A0A087WT02 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAV9-2A0A087WT02 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAV9-2A0A087WT02 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAV9-2A0A087WT02 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAV9-2A0A087WT02 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAV9-2A0A087WT02 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAV9-2A0A087WT02 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAV9-2A0A087WT02 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAV9-2A0A087WT02 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAV9-2A0A087WT02 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAV9-2A0A087WT02 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAV9-2A0A087WT02 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAV9-2A0A087WT02 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAV9-2A0A087WT02 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAV9-2A0A087WT02 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAV9-2A0A087WT02 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAV9-2A0A087WT02 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAV9-2A0A087WT02 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAV9-2A0A087WT02 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAV9-2A0A087WT02 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAV9-2A0A087WT02 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAV9-2A0A087WT02 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAV9-2A0A087WT02 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAV9-2A0A087WT02 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRAV9-2A0A087WT02 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAV9-2A0A087WT02 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAV9-2A0A087WT02 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAV9-2A0A087WT02 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAV9-2A0A087WT02 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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